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新冠病毒基因测序溯源：警告是何时拉响的( 四 )


李文亮等人揭开的盖子 ， 让基因公司测序这条线的故事 ， 与另一条临床医生预警的故事产生了交集 。 在武汉市中心医院的医生们对不断出现的病毒性肺炎病人常规治疗无效、寄望通过基因测序公司寻求答案的同时 ， 毗邻华南海鲜市场的湖北省新华医院呼吸与重症医学科主任张继先12月26日连续接诊了四名不明原因肺炎病例 ， 12月27日 ， 张继先将发现四名“不明原因病毒性肺炎”上报医院 ， 医院上报给江汉区疾控中心 。
12月28-29日 ， 新华医院又收治了三位来自华南海鲜市场的病人 ， 他们拥有相似的病毒性肺炎症状 。 根据《武汉晚报》等后来的报道 ， 12月29日下午1点 ， 新华医院副院长夏文广召集十名专家讨论这七名病例 ， 专家一致认为情况不寻常 ， 夏文广直接向省市两级卫健委疾控处报告 。 同日上报的还有武汉市中心医院公共卫生科 。 当日下午 ， 湖北省、武汉市卫健委疾控处通知省、市、区三级疾控中心 ， 新华医院、市中心医院后湖院区收治多名有海鲜市场暴露史的不明肺炎患者 ， 要求启动应急处置工作流程 。 湖北省疾控中心、武汉市疾控中心会同江汉区、硚口区、东西湖区的疾控中心开始流行病学调查 ， 武汉市金银潭医院业务副院长黄朝林等来到新华医院 ， 接走六位病人 ， 武汉市同济医院亦将前述在市中心医院第一位做基因检测的病人转入金银潭医院 。
12月30日 ， 三级疾控中心形成《关于医院报告华南海鲜市场多例肺炎病例情况的调查处置报告》 。 同日 ， 武汉市卫健委发布内部通知 ， 提及武汉多家医疗机构确实陆续出现多例不明原因肺炎病例 ， 并与武汉华南海鲜批发市场有关联 ， 要求各医疗机构上报近一周接诊过的具有类似特点的不明原因肺炎病人 。
这份因为张继先坚持上报而触发的武汉市卫健委《关于做好不明原因肺炎救治工作的紧急通知》 ， 很快被曝光于网上 ， 与看到基因测序报告的李文亮等医生的微信预警一起 ， 让发端于武汉的这场疫情信息第一次传递到外部世界 。
来自上海的预警
武汉市中心医院的另一份病例样本来自同样毗邻华南海鲜市场的后湖院区 ， 收治入院要更早一天 。 病人同样姓陈 ， 是一名福建泉州籍的41岁海鲜市场个体经营者 ， 12月20日受凉后出现高烧40°C、全身酸疼乏力、咳嗽脓痰、胸闷气短等症状 ， 12月26日在武汉市中心医院后湖院区以“发热查因、肺部感染”住院 ， 12月30日医院对其进行支气管镜取样 ， 呼吸道灌洗液样本中多留了一份放入冰箱在-80°C环境保存 。
“之所以多留一份样本 ， 是因为我们跟复旦大学附属上海市公共卫生临床中心（下称上海公卫中心）、武汉市疾控中心等一直有国家重大科技项目‘中国主要自然疫源性病毒资源’的课题合作 ， 合作协议连续签了已经有五年了 ， 武汉市疾控中心负责在华中片区的临床样本和环境标本的采集 ， 定期送到上海公卫中心做病原体检测 ， 他们有生物安全三级（BSL-3）实验室 ， 有高通量测序和生物信息分析平台 ， 而像我们医院是武汉市疾控中心的哨点医院 。 ”武汉中心医院呼吸内科赵苏教授介绍 。
12月30日下午 ， 样本由武汉市疾控中心一位主任医师取走 。 1月2日 ， 武汉市疾控中心另一位研究人员将样本用干冰、铁盒和泡沫箱重重包裹 ， 和其他动物标本一起 ， 经铁路快运送往上海 。 1月3日 ， 上海公共卫生临床中心张永振教授团队收到样本 。 这家中心属复旦大学 ， 张永振本人则是中国疾病预防控制中心传染病预防控制所研究员 ， 复旦大学生物医学研究院、上海公卫中心兼职教授 ， 近年来一直在国家自然基金、国家重大专项、国家重点研发计划等资助下从事人兽共患病、中国主要自然疫源性病毒资源的调查等科研工作 ， 包括武汉市中心医院在内的多家医院和武汉市疾控中心以及澳大利亚悉尼大学等均为课题团队成员 。
1月5日凌晨 ， 张永振研究团队从样本中检测出一种新型SARS样冠状病毒 ， 并通过高通量测序获得了该病毒的全基因组序列；根据测序数据绘制的进化树 ， 也证实武汉新型冠状病毒是历史上从未有过的 。 上海公卫中心当日立即向上海市卫健委和国家卫健委等主管部门报告 ， 提醒他们新病毒与SARS同源 ， 应是经呼吸道传播 ， 建议在公共场合采取相应疾控防疫措施 。 1月6日 ， 中国疾控中心内部启动二级应急响应 。


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