新冠病毒基因测序溯源：警告是何时拉响的
财新独家|新冠病毒基因测序溯源：警报是何时拉响的
lightningwing
新冠病毒的分离、检测和基因测序 ， 正是了解和判断新冠病疫传染力及危害性的基础 。 这一研究是何时、如何开始的？1月11日 ， 停止更新多日的武汉卫健委通报 ， 第一次将“不明原因的病毒性肺炎”更名为“新型冠状病毒感染的肺炎” ， 称截至2020年1月10日24时 ， 初步诊断有新冠肺炎病例41例
12月30日拿到病毒样本的中科院病毒所 ， 2020年1月1日进行病毒分离 ， 1月2日完成了病毒的基因测序 ， 1月5日分离得到病毒毒株 ， 1月9日完成国家病毒资源库入库及标准化保藏 。 资料图为中科院武汉病毒所 。 图/财新采访人员 丁刚
【财新网】（采访人员 高昱 彭岩锋 杨睿 冯禹丁 马丹萌）追根溯源 ， 截至2月24日已致2660多人死亡、77000多人确诊感染的新冠病毒 ， 这种与SARS相近的新型冠状病毒何时被发现？财新采访人员通过多方采访 ， 并梳理相关论文、数据库资料印证 ， 使信息拼图逐渐完整地浮现出来 。 种种证据显示 ， 在去年12月底之前 ， 有不少于9名不明肺炎病例的样本被从武汉各医院采集 ， 基因测序显示病原体是一种类SARS冠状病毒 ， 这些检测结果陆续回馈医院并上报给了卫健委和疾控系统 。 直至1月9日 ， 央视报道 ， “武汉病毒性肺炎病原检测结果初步评估专家组”正式宣布病原体为“新型冠状病毒” 。
首例12月27日即出结果
2019年12月15日 ， 一名65岁的华南海鲜市场男性送货员开始发烧 。 12月18日 ， 他来到武汉市中心医院本院（南京路院区）急诊科看病 ， 医生怀疑可能是社区获得性肺炎 ， 将其收治入该院急诊科病房 。 社区获得性肺炎是一类由细菌、病毒、衣原体和支原体等多种微生物所引起的肺炎的泛称 ， 主要临床症状有咳嗽、伴或不伴咳痰和胸疼 。
12月22日 ， 这位病人病情加重 ， 进入ICU ， 医生们使用了各种抗生素治疗无效 。 武汉市中心医院呼吸内科主任医师赵苏教授告诉财新采访人员 ， 12月24日 ， 呼吸内科一名副主任医师对这位病人进行了气管镜采样 ， 然后将病人的肺泡灌洗液样本送到第三方检测机构广州微远基因科技有限公司进行NGS检测 ， 希望利用其基于宏基因组学的二代高通量基因测序技术（mNGS） ， 找出病原体 。 肺泡灌洗是一种清除肺泡内炎性分泌物等、改善呼吸功能的治疗方法 ， 对下呼吸道和肺部疾病来说 ， 肺泡灌洗液中的病原体含量高于咽拭子 。
微远基因全称广州微远基因科技有限公司 ， 成立于2018年6月 。 其招聘广告称专注于肿瘤学和感染病原学精准医疗 ， 拥有基于二代高通量测序技术的测序平台（NGS） 。
“自华大基因利用测序技术起家以来 ， 国内大大小小出现了好多家基因测序公司 ， 这些年我们各类医学研讨会上 ， 二代高通量基因测序技术不断被介绍 ， 这些公司也派出医药代表到各大医院宣讲 。 ”赵苏对财新采访人员说 。 华大基因（ 300676.SZ ）全称为深圳华大基因股份有限公司 ， 原名北京华大基因研究中心 ， 成立于1999年 ， 先后完成了国际人类基因组计划中国部分、水稻和大熊猫基因组计划等多项具有国际先进水平的基因组研究工作 。 2017年7月以“基因测序第一股”登陆创业板 ， 是全球最大的基因组学研发机构 。
新冠病毒基因测序溯源：警告是何时拉响的。另一位武汉协和医院的医生也介绍 ， “测一次 ， 600万个碱基序列 ， 3000元 ， 这3000元能查出来病原体究竟是什么病毒或者细菌 ， 就可能救命 。 ”
一般来说 ， 基因测序公司应当在三天后 ， 也就是12月27日反馈检测结果 ， 但微远基因并没有给出书面报告 。 “他们只是电话通知我们 ， 说是一种新的冠状病毒 。 ”赵苏说 。 此时这名病人已经于12月25日转入武汉同济医院 。
推荐阅读
- 中国疾控中心称病毒并非从武汉海鲜市场向人类传播
- 英超：莱斯特城领队回忆新冠肺炎之痛
- 如果一个地方被病毒笼罩了很多年会怎样？
- 美军哗变火种积累已久，这次会燎原吗？
- 全球首个新冠肺炎抗体药物开始人体临床试验
- 新冠疫情会怎样结束？权威专家分析了5种可能
- 新冠病毒在意大利已经不存在
- “种族歧视病毒“的锅如何甩？
- 澎湃新闻 研究：新冠病毒可令患者出现冻疮样皮肤病变
- 武汉感染新冠医生胡卫锋抢救无效离世