「新冠病毒」最新研究驳斥新冠病毒为“人造”产物 蛇不是中间宿主
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当科学家们争相了解更多关于SARS-CoV-2冠状病毒的信息时，最近对该病毒基因组的两项研究得出了有争议的结论：蛇是这种新病毒的中间宿主，以及一种关键的冠状病毒蛋白与HIV-1蛋白有着“不可思议的相似之处”。
现在，最新发表在ACS《蛋白质组研究杂志》上的一项研究反驳了这两种观点，并指出，有鳞的、类食蚁兽的穿山甲是在蝙蝠和人类之间传播SARS-CoV-2的缺失环节。
了解致使新冠肺炎在全球蔓延的SARS-CoV-2病毒的来源和传播方式，对其控制和治疗非常重要。大多数专家认为，蝙蝠是天然的SARS-CoV-2宿主，但要让这种病毒从蝙蝠传染给人类，还需要一个中间宿主。
此前，一项研究分析了SARS-CoV-2病毒的基因组，结果表明蛇是这种病毒的宿主，尽管目前已知的冠状病毒只会感染哺乳动物和鸟类。与此同时，一项不相关的研究比较了新型冠状病毒和HIV-1的突刺蛋白序列，发现了意想不到的相似之处。虽然作者在受到科学批评后撤回了这篇预印稿，但由此引发了一些谣言和阴谋论，认为这种新型冠状病毒可能是在实验室中设计出来的。
现在，Yang Zhang和同事们希望对SARS-CoV-2 DNA和蛋白质序列进行更仔细和完整的分析，以解决这些问题。
与以前的研究相比，研究人员使用更大的数据集和更新、更准确的生物信息学方法和数据库来分析SARS-CoV-2基因组。他们发现，与声称SARS-CoV-2和HIV-1之间只共享4个突刺蛋白区域不同，这4个序列片段可以在其他病毒中发现，包括蝙蝠冠状病毒。
在发现蛇是中间宿主的分析有误后，研究小组从穿山甲组织中分离出DNA和蛋白质序列，寻找类似于SARS-CoV-2的基因。
而研究人员在患病动物的肺中发现了91%与人类病毒蛋白质相同的蛋白质序列。此外，穿山甲冠状病毒突刺蛋白的受体结合域仅与SARS-CoV-2存在5个氨基酸差异，而人与蝙蝠病毒蛋白的差异为19个。
因此，研究人员认为，这一证据表明穿山甲是最有可能的新冠状病毒中间宿主，但也有可能是其他中间宿主。
这篇论文于3月22日发表在《蛋白质组研究杂志》上，题目为“2019-nCoV基因组的蛋白质结构和序列再分析，驳斥了蛇作为中间宿主以及其与HIV-1的突刺蛋白插入的独特相似性”。研究团队来自密西根大学生物化学系、计算医学与生物资讯学系，Yang Zhang为通讯作者。
研究人员表示，虽然现在人们普遍认为，像菊头蝙蝠可能是2019-nCoV的天然宿主，但是究竟是哪种动物作为中间宿主将蝙蝠冠状病毒带到人类宿主中，目前还不清楚。尽管多项研究表明马来亚穿山甲是另一宿主，但也一些研究提出穿山甲可能是一种天然宿主，而不是中间宿主。
为了进一步研究2019-nCoV传播的动物宿主，研究人员使用马来亚穿山甲的宏基因组样本，组装了一种高度相关的冠状病毒的基因组草图。组装的基因组序列的比对结果，特别是在突刺蛋白上的比对结果，表明穿山甲在2019-nCoV的进化及其从蝙蝠向人类传播中的重要性。
研究结果：
1. 2019-nCoV突刺蛋白不包括HIV-1特有的插入片段
在此前的一篇题为“2019-nCoV突刺蛋白中独特插入片段与HIV-1 gp120和Gag的异常相似性”的论文中，印度理工学院的Pradhan等人提出了一个发现，即2019-nCoV突刺蛋白特有的四个新插入(图1)。他们进一步得出结论，这四个插入片段是2019-nCoV受体结合位点的一部分，并且这些插入与HIV-1蛋白具有“不可思议的相似性”，但与其他冠状病毒则没有“相似性”。
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这些说法在社会上引起了相当大的公众恐慌和争议，甚至在论文被撤回后阴谋论也依旧满天飞。为了研究Pradhan等人的结论是否具有科学的精确性，研究人员重新分析了其中所讨论的四个突刺蛋白插入的结构位置和序列同源性。
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