怎样用DNAMAN分析一对引物的退火温度、与DNA链的互补配对情况等?

退火温度已设计好的引物后边的温度值就是根据引物自身的碱基情况计算出的理论值,但是实际的PCR退火温度需要进行测退火PCR才能知道。单条引物的分析首先copy引物序列——点击DNAMAN工具栏的Primer选择其中的load primer, From input,paste,OK,self-complementarity即可出来单条引物的序列分析结果,有自由能、自身配对。一对引物的分析首先将F向引物导入:copy序列,primer,load primer,from input ,粘贴,OK然后导入R向引物序列:copy引物序列,primer,two primer complementarity,second primer from input,粘贴,OK,显示的结果就是上下游引物之间的连续/不连续配对碱基,自由能的情况。


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