在陈元赞的所有日本弟子中，矾贝茨郎，三蒲义辰，福野正夫三人深得真传，后来，这三名拳法师被奉为“日本中古柔术之祖”，在日本各地教习武艺。日本的“起倒流柔术”，实际上，就是中国古拳法的一种传承。
东京拳法碑的记载：“拳法自有传也，自投化明人陈元赞而起。”而日本掌秘中亦提到了这一沿革：“福野等三人，从陈元赞学得其术，是即起倒流。”
台湾省史学家梁容在著《陈元赞评传》中提到：“元赞寓居国正(昌)寺时，福野等三人寓同寺。元赞授予之武术，三人苦心研究，遂通蕴奥，遍传各地，屡有改进，渐与日本之固有柔术相结合，形成新的流派。”
在日本武术中，素有“当身”、“活杀”等技巧。根据考证，这些技巧在明代之前并未出现，这些武术都是在陈元赞出使日本后诞生的。
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当然，少林武僧之所以成为传奇，不只是因为少林寺拥有完整且出色的武学体系，还要归功于少林武僧在抗倭期间做出的突出贡献。
《目知录》、《云问杂志》这些著作中，均提到了少林武僧在抗倭期间的出色表现。《云问杂志》记载，1553年，月空禅师接到都督的讨倭檄文，率领少林寺三十余名武僧前往松江，协助官兵进行抗倭。当月空来到前线以后，倭寇正集结在营地中，月空手持铁棍，从贼众的头顶上踩过，一棍敲碎了贼酋的头盖骨，斩杀贼首。
《上海掌故丛书·吴淞甲乙倭变志》记载，1553年六月，明军与倭寇会战于南汇，在这场恶战中有四名武僧丧生，而他们却杀掉了近百名倭寇。当时日本人中有一身穿红衣的武士十分凶悍，领兵的月空禅师与其他僧众心知此人武艺高超无法力敌，皆震惊失色。唯一僧人智囊神色如常，主动请缨出战。
智囊手持铁棍，一个纵身跳到红衣武士左近，一棍便打得此人滚转，随后智囊夺过倭刀，一刀劈死了红衣武士。红衣死后，倭寇纷纷跪在地上求饶。此战总共歼敌百名，唯了心、彻堂、一峰、真元四名武僧因追击太深身陷重围死于倭寇之手。
1554年二月，官兵与日寇会战于叶谢、马家浜等地，僧兵主动担任先锋，击毙敌寇甚多。然而，由于官兵的支援不济，僧兵又对当地的地形缺乏了解，在冲杀过后陷入了敌人的包围圈。在这场战斗中，包括大有、西堂、天移、古峰等高僧在内的二十一名武僧丧生。
1555年十月，浙江提督率浙江官兵迎击倭寇，少林僧兵再次请缨为先锋。少林僧众率先冲杀到倭寇营门前，手持铁棍击杀倭寇。倭寇无僧兵一合之敌，“遇者即倒”，仅一个冲锋，就有大量倭寇死于僧兵铁棍。
然而，狡猾的倭寇穿上此前缴获明军的装备，扮作官兵蛊惑僧众，从后方偷袭了僧兵。僧兵不知这些“官兵”的来路，还以为是友军策应，这些伪装成官兵的倭寇杀掉了大部分僧兵，以至于少林高僧“缰尸满田野”。事后朝廷收敛了所有战死僧兵的骨殖，为他们修建了佛塔。
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由于，少林武僧在抗倭战争中表现出众，亦不乏武僧被朝廷吸纳为武将。
少林武僧边澄、三奇、友公多次参与抗倭战争，并协助官兵镇守云南，屡立奇功。正德六年，京城乃至江淮一带发生民变，出现了许多聚义揭竿的暴民。三奇被朝廷任命为“天下对手教会武僧”，被调遣到直隶地区参与关隘的防御。三奇率领一千多名僧兵维护直隶治安，击溃了多股暴民，立下汗马功劳。后来，三奇被正德帝提拔为提督，统征云南。
因为少林僧兵在抗倭战争中表现突出，所以有许多僧兵青史留名。如月空、天池、一舟、玉田、太虚、性空、东明、古泉、大用、碧溪、智携、大有、西堂、天移、古峰、了心、彻堂、一峰、真元、孤舟、天真、元极、天元等高僧，均在这场抗倭战争中立下汗马功劳。少林武僧的鼎盛时期，寺院常备僧兵突破了千人。
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