正德十四年（1519）六月，被封在南昌的宁王朱宸濠起兵造反。王守仁当时正奉命到福建查办兵变事件，中途听说宁王叛乱，遂一面上书皇帝，一面联络江西各地官员，准备平叛。由于叛军声势浩大，王守仁假造了多份朝廷公文，宣称各地精兵将陆续调赴江西，又离间宁王和谋士、将领的关系。宁王既害怕朝廷真的早有准备，又怕部下生变，乃迟疑不决。王守仁因此争取到了十余日的准备时间。
七月一日，宁王挥师东进，围攻安庆。王守仁遂从吉安出师，在樟树镇集合临江、袁州等数府的兵马北上。当时有人建议引兵蹑叛军之后，以解安庆之围，王守仁反对说：“九江、南康都已投降宁王，我军如果越过两城直向安庆，敌军必然回师死战，对我们反而不利。不如直取南昌，逼迫叛军回师，安庆之围自解。”当时南昌守备甚严，郊外还有一支叛军作为呼应，王守仁先袭破郊外叛军，进而全军齐发，黎明即抵南昌城下，城中震动。官军乘机登城，一举克定。入城后，王守仁果断下令诛杀掠夺百姓的乱兵，迅速安定了人心。
宁王得知南昌告急，即刻回援，与官军战于黄家渡，不利。次日，叛军又来攻，官军一度小败，有些士卒临阵逃跑，此时王守仁斩逃卒以徇众，三军复振，遂破叛军。又次日晨，宁王正整顿军队，王守仁已派出部队火攻敌船，叛军因此大溃，主要首领自宁王以下都被擒获，叛乱遂平。此时距叛乱爆发才三十五天，明武宗亲自率领的平叛部队尚未从京城出发，而王守仁所部仅是临时凑集的地方部队，各部队的指挥者又多是文官，竟能成就大功，实在令人惊讶。这也是王守仁最受后世称颂的一次军事行动。
当叛乱初起时，大臣多惶恐不安，唯有兵部尚书王琼说：“王伯安居南昌上游，必擒贼。”后来果然被他言中。然而王守仁虽建大勋，却被武宗的宠臣江彬等嫉妒，当武宗率军抵达南方后，江彬便屡次向武宗诬告他有反意。幸而武宗还算清醒，反驳道：“王守仁学道人，闻召即至，何谓反？”这才没有使这位有功于明室的名臣无辜受祸。
武宗去世后，世宗（即嘉靖帝）即位，江彬等权幸被清除。然而在世宗朝初年错综复杂的政治局面下，王守仁还是屡遭攻讦。嘉靖元年（1522），心力交瘁的王守仁丁忧去职，直至嘉靖六年（1527），因广西田州土司叛乱，时任总督征讨不利，才被重新起用。到广西后，他招抚了叛军，又征讨断藤峡。奏捷之后，朝中大臣却“诋守仁征抚交失”，不加赏赐，虽有人为王守仁诉功，世宗仅“报闻而已”。
嘉靖七年（1528），王守仁因病情已重，上书告归，回家途中病逝（时间为公历1529年1月9日），去世地点正是他曾抚治过的南安府，时年五十七岁。其丧过江西，军民感其德，无不缟素哭送。然而在朝廷中，对王守仁的攻击正达到一个新的高峰：“守仁既卒，桂萼奏其擅离职守。帝大怒，下廷臣议。……帝乃下诏停世袭，恤典俱不行。”
此时，王守仁的功绩被批评、轻视，学说也被诋为“伪学”，连应有的饰终之典都被取消。看起来，他几乎要在历史长河的浪花中消失了。然而历史终究是公平的，世宗去世后，其子穆宗继位，王守仁又重新被人想起，“廷臣多颂其功”。于是，穆宗诏赠王守仁为新建侯，赐谥文成。隆庆二年（1568），又以其子王正亿袭新建伯爵位。被人为扭曲的历史，终于还是在王守仁去世四十年后重新被纠正过来。
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王阳明故居
“阳明学”的创立与影响
如上文所说，王守仁晚年屡遭攻击，受到了很多不公平的待遇。究其原因，半由平宁王之乱的功劳惹人嫉恨，半因学术观点与主流的程朱理学不合。如他去世后，桂萼等人就攻击其学说道：“守仁事不师古，言不称师。欲立异以为高，则非朱熹格物致知之论；知众论之不予，则为朱熹晚年定论之书。号召门徒，互相倡和。才美者乐其任意，庸鄙者借其虚声。传习转讹，背谬弥甚。但讨捕軬贼，擒获叛藩，功有足录，宜免追夺伯爵以章大信，禁邪说以正人心。”然而到了嘉靖末年，“阳明学”已经成为当时儒家学派的显学之一，王学门人徐阶官至首辅，王守仁也于万历年间获得从祀文庙的待遇，成为“先儒”之一，一度与朱熹平起平坐。此后，学者对王阳明的评价更多地指向其学说的价值和影响，而其生前事功反而略而不谈了。那么，阳明之学究竟是怎样的一种学说，其本末源流又是怎么一回事呢？
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