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数据库|重磅！科学家开发出用于精准化医学研究的人类免疫组学在线图谱


近日 ， 一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中 ， 来自Duke-NUS医学院等机构的科学家们通过研究开发出了一种人类免疫组或组成免疫系统的基因和蛋白质的交互式网络图谱 ， 这种图谱被称为EPIC（扩展的多维免疫组学特征 ， Extended Polydimensional Immunome Characterisation） ， 其拥有一个全面的扩展的免疫细胞数据库 ， 其范围涵盖脐带血至成年阶段 ， 目前能被全球科学家们用来研究机体的免疫学机制 。
数据库|重磅！科学家开发出用于精准化医学研究的人类免疫组学在线图谱
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图片来源：CC0 Public Domain
【数据库|重磅！科学家开发出用于精准化医学研究的人类免疫组学在线图谱】免疫系统是一种复杂的细胞和蛋白质网络 ， 其能保护机体抵御感染和疾病发生 ， 目前研究人员拥有极大的兴趣去研究人类的免疫组及其工作机制 ， 同时他们也想去理解为何不同个体对病毒、疗法和疫苗会产生不同反应 ， 深入理解人类的免疫组有望帮助开发治疗疾病的多种有效疗法或新型疫苗 。 EPIC能通过提供免疫图谱的组成并利用人工智能来分层并分析数据集 ， 在扩大和深入进行相关研究中扮演着关键角色 ， 如今研究者就能利用EPIC来探索不同年龄组的人类免疫组的整体结构 ， 或分析特定的细胞类型 ， 也就是说 ， EPIC能用于基础、转化和临床等研究中 。
研究者Salvatore Albani说道 ， 对人类免疫组的研究类似于在细胞水平下对人体进行MRI扫描成像 ， 从而就能帮助我们发现什么是对的 ， 什么是错的 ， 以及我们如何解决疾病；我们希望 ， EPIC能作为一种人类免疫组的全面数据库和分析工具 ， 来帮助临床研究人员理解机体免疫力发生的机制 ， 并预测人类对个体化疗法的临床反应 ， 甚至有望帮助开发新型疫苗和疾病疗法 。 研究者能深入挖掘EPIC中的数据库 ， 不仅能获得按个细胞子集的详细和完整的信息 ， 还能够获得免疫系统的发育和成熟进化信息 ， 同时还能帮助临床研究人员制定正确的角色 ， 并能为匹配不同免疫系统的新型疗法来确定新的靶点 。
研究者Albani表示 ， EPIC还能够加速研究者寻找疫苗的进程 ， 当我们开发疫苗时就需要观察能够预测机体对潜在疫苗反应的免疫特征 ， 而EPIC则能够帮助快速识别这些特征 ， 并加速疫苗开发的进程 。 目前EPIC能被临床科学家们用来研究多种人类疾病 ， 比如关节炎、癌症和免疫功能缺陷等疾病 ， 同时研究者还能利用EPIC来识别潜在的治疗性靶点及与自身免疫性疾病患者较差临床预后相关的免疫特征 。
此外 ， EPIC还能被使用免疫学数据进行研究的临床科学家们所利用 ， 因为其能提供一个大规模的健康细胞分析数据库及正确的工具来对相关数据进行分析 ， 其所内置的生物信息学机制能帮助分析相关的数据 ， EPIC的另一个独特之处在于其数据的呈现是动态和交互式的 ， 这就能够帮助研究人员从不同的角度来观察并分析数据 。
转化研究是一个非常漫长的过程 ， 其会占用大量的时间和资源 ， 研究人员期待 ， 未来EPIC能作为一种智能免疫数据和分析工具 ， 来帮助简化并加速免疫学研究和转化医学研究 ， 从而为更多的临床研究铺平道路 。 最初EPIC仅从亚洲人群的表型开始 ， 但随着时间推移 ， 其还将包括来自国际上的免疫细胞数据库 ， 比如欧盟和美国等 ， 如今EPIC被设计成为一种开放性的工具 ， 其能被全球的科学家们所使用 ， 反之 ， 任何科学家都能够贡献自己的样本、数据和新的分析工具 。 （生物谷Bioon.com）
原始出处：
Yeo, J.G., Wasser, M., Kumar, P. et al. The Extended Polydimensional Immunome Characterization (EPIC) web-based reference and discovery tool for cytometry data. Nat Biotechnol 38, 679–684 (2020). doi：10.1038/s41587-020-0532-1


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