@最新重磅：吃了蝙蝠的流浪狗，可能才是人类感染新冠病毒的源头( 二 )
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研究人员表示 ， 很不幸的是 ， BatCoV RaTG13 没有在 2013 年进行测序 ， 否则 CpG 含量的下降可能是一个警告 。 因为这有两个非常重要的含义 。 首先 ， 这种病毒可能是在具有高 ZAP 表达的组织中进化而来的 ， 因此 ZAP 高表达有利于 CpG 低的病毒基因组出现；第二 ， 更重要的是 ， 该病毒的存在表明它已经成功地避开了 ZPA 介导的抗病毒防御 。 换句话说 ， 这种病毒已经变得很隐秘和狡猾 ， 对人类来说也已经很危险了 。
最合理的解释：流浪狗吃了蝙蝠？
夏旭华教授用他的 CpG 检测工具重新检测了起源于骆驼的中东呼吸综合征冠状病毒（MERS） ， 发现感染骆驼消化系统的病毒基因组中 CpG 含量低于感染骆驼呼吸系统的病毒 。
当他在对狗的数据进行分析后 ， 发现只有犬冠状病毒 (CCoVs) 的基因组具有与 SARS-CoV-2 和 BatCoV RaTG13 相似的基因组 CpG 值；其次 ， 犬和骆驼一样 ， 在它们的消化系统中也发现了冠状病毒感染 ， 而且其 CpG 含量低于它们呼吸系统中的基因组 CpG 含量 (犬呼吸道冠状病毒与 SARS-CoV-2 同属于 BetaCoV 谱系) 。
此外 ， 已知 SARS-CoV-2 进入细胞的受体是 ACE2 ， ACE2 产生于人体消化系统 ， 在小肠和十二指肠具有最高水平 ， 在肺部的表达相对较低 。 这表明 ， 哺乳动物的消化系统可能是冠状病毒感染的一个关键目标 。 
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研究人员表示 ， “最近的研究报道进一步证实了这一解释 ， 即大部分的新冠肺炎患者也有消化不适的症状 。 事实上 ， 48.5% 的人以消化系统症状为主要症状 。 ”
众所周知 ， 犬科动物经常舔它们的肛门和生殖器区域 ， 不仅在交配期间 ， 在平常情况下也是如此 。 这种行为将促进病毒从消化系统传播到呼吸系统 ， 并促进胃肠道病原体与呼吸道和肺病原体之间的交换 。
“在这种情况下 ， 很重要的一点是 ， 其基因组序列记录在 GenBank (MN996532) 中的蝙蝠冠状病毒 (BatCoV RaTG13) ， 是从粪便拭子中分离出来的 。 这些观察结果与 SARS-CoV-2 在哺乳动物肠道或与肠道相关的组织中进化的假设是一致的 。 ”
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研究人员的另一项发现 ， 涉及从穿山甲中分离出的病毒 。 科学家们最近从穿山甲中分离并测序了 9 个类似 SARS-CoV-2 病毒的基因组 ， 夏旭华教授发现 ， 具有最高序列覆盖率的 ICpG 值为 0.3929 ， 其值接近在 SARS-CoV-2 基因组中观察到的 CpG 值的极低端 。 因此 ， 造成此次大流行的 SARS-CoV-2、蝙蝠中的冠状病毒 BatCoV RaTG13 和穿山甲携带的冠状病毒 ， 可能有一个共同的低 CpG 祖先 ， 或者趋同进化出了低 CpG 值 。 ”
根据研究结果 ， 夏旭华教授提出了一种假设 ， 即：
冠状病毒首先从蝙蝠传播到吃蝙蝠肉的流浪狗；接下来 ， 病毒在犬类肠道不断变异进化 ， 导致病毒基因组 CpG 减少；最后 ， 较低的病毒基因组 CpG ， 使病毒能够逃避人类 ZAP 介导的免疫反应 ， 最终感染人类 ， 并迅速成为一种严重的全球大流行病病原体 。
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“SARS-CoV-2 的具体起源在当前这场世界卫生危机中至关重要 ， 这项研究通过考虑宿主防御系统与病毒基因组的相互作用 ， 包括宿主组织对病毒基因组进化的选择压力 ， 揭示出病毒进化相关的重要证据 。 ” 夏旭华说 。
夏旭华教授简介
夏旭华 ， 加拿大渥太华大学终身教授、生物信息学与数学计算机专家 ， 加拿大渥太华大学理学院生物系生物信息学首席科学家、博士生导师 ， 世界生物信息学领域中的重量级学者 。
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