病毒@研究表明:新冠病毒可能于去年11月出现,变异一直在发生
【病毒@研究表明:新冠病毒可能于去年11月出现,变异一直在发生】对38个病毒毒株进行基因序列比较后 , 研究人员发现从疫情发生至今 , 病毒虽在变异 , 但变化不大 。 研究人员发现了 117处变异 , 变异位点没有聚集性 , 相对均匀地分布在整个基因组 , 这表明目前的突变 , 尚未出现特别“激进”的变异之处 。
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文/《财经》采访人员 孙爱民
新冠病毒肺炎疫情已经两个多月 , 人们对罪魁病毒的认知还十分有限 。
【病毒@研究表明:新冠病毒可能于去年11月出现,变异一直在发生】2月22日 , 南方医科大学学者通过对39条新冠病毒(SARS-CoV-2)序列进行研究 , 发现病毒可能出现在2019年11月左右 。 这一结论与学术界和官方认为的最早病例出现的时间相符:卫生部门与疾控系统普遍认可第一例病例发生于2019年12月8日 , 《柳叶刀》的一篇论文则认为是2019年12月1日 。
对38个病毒毒株进行基因序列比较后 , 研究人员发现从疫情发生至今 , 病毒虽在变异 , 但变化不大 。
研究人员发现了 117处变异 , 变异位点没有聚集性 , 相对均匀地分布在整个基因组 , 这表明目前的突变 , 尚未出现特别“激进”的变异之处 。
该研究在《南方医科大学学报》网络首发 , 由南方医科大学公共卫生学院生物安全防护三级(P3)实验室副主任张宝教授领衔的科研团队完成 。
全球多支研究团队 , 正在试图攻克新冠病毒 。 来自浙江、北京、湖北武汉等的多个P3实验室 , 正进行活体病毒的相关研究 。
尽管病毒的基因组在疫情发生后很快被解析 , 基因组特征正被一层层揭晓 , 但这些特征还难以解释病毒为何具有强传播力 。 而病毒出现的时间 , 以及是否有中间宿主、传染源是什么、传染病是否会一直存在 , 也都是谜 。 这些问题 , 同样是解开新冠病毒强传播力的钥匙密码 。
“说实话 , 我们仍然不知道病毒来自哪里”
谁是第一例新冠肺炎患者 , 至今没有消息 , 有人甚至已悲观地预测 , 会像SARS第一例患者的追寻一样 , 无疾而终 。
从第一例患者 , 可以通过流行病学调查 , 来倒推病毒的由来、寻找传染源 。 以中国疾控中心为主要参加单位的论文 , 普遍将2019年12月8日作为此次疫情第一例患者的住院时间 , 这也是武汉市卫健委等官方认可的时间点 。
中日友好医院副院长曹彬等 , 在《柳叶刀》上发表的论文 , 则将一例2019年12月1日住院的病例 , 作为疫情的第一例患者 。
另一种方式 , 是通过对病毒基因序列的研究 , 通过病毒基因组的特性 , 来推测病毒出现的时间 。 张宝研究团队 , 应用进化时间信号分析软件TempEst , 分析当前基因组数据 , 然后进行了tMRCA(最近共同祖先出现时间)分析 。
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按照上述思路 , 遴选最佳核苷酸替代模型参数 , 将其采样时间2020年1月23日作为第0天 , 研究者最终推算新冠病毒出现的时间为此前38.9天到119.3天 , 即2019年9月23日到2019年12月15日之间 。 “按照模型计算 , 病毒出现时间为1月23日往前平均73天 , 95%可信区间是38到113天 。 所以 , 2019年11月10日是平均值 。 ”张宝对《财经》采访人员分析 。
“病毒最先在2019年11月份出现” , 这一推算与《科学》杂志的一篇报道相符 。
1月24日 , 北京中日友好医院副院长曹彬、武汉市金银潭医院胸外科主任医师黄朝林等人 , 在《柳叶刀》上在线发表的论文 , 对最初感染的41个病人的临床症状进行了分析和总结 , 发现41例患者中有27例曾接触过华南海鲜市场 , 并将2019年12月1日的病例作为此次疫情的最早病例 。
两天后 , 《科学》杂志因此撰文援引美国乔治敦大学传染病学专家Daniel Lucey的说法:如果12月1日出现首个病例 , 也确实没有华南海鲜批发市场的暴露史 , 考虑到潜伏期的因素 , 这个人很可能是在11月就感染了病毒 , “这种病毒是先被带入市场 , 然后才被带出市场的” 。
不过 , 曹彬在接受《科学》采访时称 , “说实话 , 我们仍然不知道病毒来自哪里” 。
变异一直在发生 , 未产生全新毒株
新冠病毒发生两个多月 , 截至2月24日18时 , 仅中国便有77000多例确诊患者 。 公众担心病毒是否在快速变异 , 会不会杀伤力更强 。 近期的多项研究 , 可扫除此种担忧 。
张宝的研究团队 , 将38株病毒基因序列进行比较研究后发现:核苷酸之间变化差异非常小 , 以最早测定的序列为参考 , 共计有117处变异 , 变异位点没有聚集性 , 相对均匀地分布整个基因组 。
香港研究者发现 , 从香港患者身上检测出来的毒株 , 与武汉患者毒株相比 , 只差6个核苷酸 。
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