R语言聚类分析,怎样导出将分类结果( 二 )



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我们可以看到,Setosa物种与Versicolor和Virginica明显不同(它们具有较低的花瓣长度和宽度)。但是,基于对萼片和花瓣宽度/长度的测量,不易将Versicolor和Virginica分开。
通过查看数据的平行坐标图可以得出同样的结论:

R语言聚类分析,怎样导出将分类结果

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我们可以通过将对象转化为树状图并对对象进行一些调整来可视化运行它的结果

R语言聚类分析,怎样导出将分类结果

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相同的可以在圆形布局中呈现:

R语言聚类分析,怎样导出将分类结果

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这些可视化很容易证明分层聚类的分离对于“Setosa”物种来说是非常好的,但是在将许多“Versicolor”物种标记为“Virginica”时未能实现。
我们也可以使用热图探索数据。
在热图中,我们还可以看到Setosa物种的花瓣值如何(浅黄色),但很难看出其他两种物种之间的明显区别。

R语言聚类分析,怎样导出将分类结果

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各种聚类算法之间的相似/不同为了进行这种分析,我们将创建所有8个hclust对象,并将它们链接在一起成为一个dendlist对象(顾名思义,它可以将一组树状图组合在一起用于进一步分析)。
接下来,我们可以看看每个聚类结果之间的同源相关性cor.dendlist。(这可以使用corrplot包中的corrplot函数很好地绘制):

R语言聚类分析,怎样导出将分类结果

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从上图中我们可以很容易地看到,除了完整的方法(默认方法in hclust),大多数聚类方法的结果非常相似,其结果相关度大约为0.6。
默认的同源相关使用皮尔逊的度量,但如果我们使用spearman的相关系数呢?

R语言聚类分析,怎样导出将分类结果

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我们可以看到,相关性不是很强,表明一个行为依赖于彼此距离很远的一些项目,这些项目对皮尔森相关性的影响相关性更大。
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Python数据可视化-seaborn Iris鸢尾花数据
learn和pandas决策树进行iris鸢尾花数据分类建模和...


■网友
str()看看变量里面有什么内容,然后拿出来就是了
■网友
今天看了决策树的用法,个人觉得不管是分类或聚类算法,出来的结果是一个“规则”。至于要怎么去分类数据,是根据这个“规则” 来做的。所以,提取数据是另外一个工作了。## 更新日期:2015/11/11前段时间在做聚类分析,用到hclust() 函数,将数据聚类分组后,对应到每一个ID。具体如下:d = dist(testdata, method = "euclidean") hcward = hclust(d, method="ward.D") data$groups = cutree(hcward,k=8) # 到这里,data 中的每个ID都对应到相应的group 了


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