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学院于1959年被定为全国16所重点高等学府之一 ， 并于1997年入选首批211工程 。
2000年 ， 上海医科大学和复旦大学合并办学 ， 组建成为新的复旦大学 。
【复旦大学医学研究院排名第几】2011年 ， 新的上海医学院成立 ， 作为复旦大学党政的派出机构 ， 根据学校的授权 ， 在大医口的人才培养、科学研究、学科建设、发展规划、资源配置、对外交流等方面 ， 行使相对独立的管理权限 。
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