R语言是比较常用的统计分析和绘图语言,拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库,是学习生物信息分析的必备语言之一 。
Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一,支持纯R脚本、Rmarkdown (脚本文档混排)、Bookdown (脚本文档混排成书)、Shiny (交互式网络应用)等 。
Rstudio版本Rsdutio分为桌面版和服务器版,桌面版可以在单机使用,服务器版可以从浏览器访问供多人使用 。
文章插图
服务器版安装好之后,访问地址为<服务器IP:8787>,用户名和密码为linux用户的用户名和密码 。
Rstudio安装R安装Linux下安装
Rstudio安装前需要安装R,如果使用的是新版的操作系统 。直接可以用sudo apt-get installl r-base 或者yum install r-base来安装 。
若系统版本老,或没有根用户权限,则需要下载编译源码安装,最新地址为
https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.4.0.tar.gz 。
具体编译方式为 (Linux下软件安装见
http://blog.genesino.com/2016/06/bash1):
# --enable-R-shlib 需要设置,使得其他程序包括Rstudio可以使用R的动态库# --prefix指定软件安装目录,需使用绝对路径./configure --prefix=/home/ehbio/R/3.4.0 --enable-R-shlib# 也可以使用这个命令,共享系统的blas库,提高运输速度#./configure --prefix=/home/ehbio/R/3.4.0 --enable-R-shlib --with-blas --with-lapackmakemake install
windows下安装下载
https://cran.r-project.org/bin/windows/双击就可以了 。
Rstudio安装Linux下安装服务器版
- 安装参考 https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/
- wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-rhel-1.0.136-x86_64.rpm
sudo yum install --nogpgcheck rstudio-server-rhel-1.0.136-x86_64.rpm - 安装完之后的检测、启动和配置
- sudo rstudio-server verify-installation
推荐阅读
- Seata Server 环境搭建
- 爬虫入门必学——常见的几种网站类型
- 环境太吵对婴儿的影响
- 小说三要素是什么?
- 从零开始学化妆超详细化妆入门教程,怎样学化妆新手如何学化妆-
- 气功入门功法是什么呢
- 少林气功入门与分类是什么
- 彩光嫩肤祛斑效果如何
- 为什么噪声也是污染?
- hr|95后打工人:“HR不用费心让我们融入公司环境,不想社交,真的拴Q”