乌兰泰总兵力数以万计，且拥有清军最精良的重炮装备，杀伤力巨大。
在长达六个半月的永安攻防战中，秦日纲充分发挥矿工的专长，在水窦山岭上挖壕筑寨，遍布地雷暗沟，防御工事做得极为坚固，愣是率部以原始、落后的武器堪堪顶住了乌兰泰的猛攻，始终未曾失守。
1852年4月，永安州城内弹尽粮绝，太平军部署突围。
秦日纲的水窦守军负责殿后，等城内军民撤尽，才于后半夜拔队尾随。
太平天国将士大部分是全家入伍，转移过程中，扶老携幼，掉队人员很多。
最终，秦日纲不得不在古苏冲、龙寮岭分两线布防，以阻击向荣、乌兰泰两支主力的追击。
太平天国运动已引起清咸丰帝的高度重视，向荣、乌兰泰岂敢跟丢？挥军疯狂追杀。
秦日纲军与人数和装备均占优势的清军血战两日，给敌人以重大杀伤，但自己也付出了沉重代价，折损了两千多人，成为了太平军自起义以来最大的一次损失。
第三日清晨，秦日纲军在浓雾中穿过崩冲，来到大厄冲，与埋伏在山头的大队伍会合。
乌兰泰部紧追不舍，很快进入了伏击圈。
太平军居高临下，火箭、土炮、硝桶、 石、地雷、滚木一齐发作，打得冲底的清军屁滚尿流。
经过半日鏖战，太平军聚歼清军五千多人，击毙清军天津镇总兵长瑞、凉州镇总兵长寿、河北镇总兵董光甲、郧阳镇总兵邵鹤龄。
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乌兰泰跳涧逃命受伤，向荣等少数残兵败将抱头鼠窜。
太平军因此稳定了局势，从而顺风顺水，出桂入湘、入鄂，从武汉出发，分水陆两路东下，攻下了南京。
1853年九月，太平天国设立侯爵，秦日纲成为第一个封侯者，被封为顶天侯。
1854年一月，翼王石达开在安庆一带安民，大得人心，政绩卓著，杨秀清深以为忌，派秦日纲代替石达开。
秦日纲到了安庆，总揽当地军政，扩增兵员，军容甚盛。
因为林凤翔、李开芳的北伐军在静海、独流被围，派去的援军败返，杨秀清派秦日纲去增援，封“燕王”，加号“霜师”。
由此，秦日纲成为五王之后第一个封王的人。
秦日纲到了舒城杨家店与清秦定三部接触了一下，就匆匆退返。
恰巧太平军老将、秋官又正丞相曾天养战死，武汉三镇失守，太平军退守田家镇。
杨秀清于是命秦日纲赴田家镇督师。
秦日纲在险要的半壁山上建立5个营垒，并在自田家镇横过半壁山的江面安放了两道铁索，铁索之下排列数十艘小船，以枪炮掩护。又在田家镇到蕲州长江北岸建筑土城，遍布炮位，好整以暇。
但是，湘军水师彭玉麟、杨载福部来势迅猛，顺江而下，用洪炉大斧破了拦江铁索，清陆师罗泽南、塔齐布两人又领军在南岸杀来。
秦日纲在田家镇、半壁山和黄梅连战三场，场场皆败，损兵数万，大小船只5000多号被焚。
情况危急，洪秀全急令石达开出马。
石达开欲擒故纵，将湘军水师精锐部队诱入鄱阳湖中，炮火大作，焚烧敌船40多条。随后又率轻舟30多艘攻袭敌人，烧毁敌船5000多艘，差一点活捉湘军主帅曾国藩。
秦日纲乘机自宿松、太湖一带向西攻，连克广济、蕲州、黄州、汉口、汉阳，进而再次把武昌掌握在太平军手中。
早在太平天国定都天京不久，清军就相继在天京东郊和扬州建立江南、江北大营，死死地卡着天国的咽喉，并威胁镇江、瓜洲，阻太平军东进苏州、常州。
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为消此肘腋之患，1856年二月，东王杨秀清从安徽调集数万人，由燕王秦日纲统率，配备陈玉成、李秀成、陈仕章、涂振兴、周胜坤五个丞相为副将，从栖霞、石埠桥一带东进，一则为解镇江之围，二则为破清江北大营、克扬州。
秦日纲仅用两个多月时间，就出色地完成了任务，杀死江苏巡抚吉尔杭阿，击破了清江北大营。
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