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IT|HIV研究迎来重要进展 最新《科学》揭示衣壳的重要作用

《科学》杂志10月9日发表了一篇关于HIV研究的重要论文 。美国弗吉尼亚大学（University of Virginia）和犹他大学（University of Utah）的科学家们合作，构建了一个无细胞的体系，首次让HIV在体外依次完成逆转录和整合 。
通过这个无细胞的体系，科学家们得以更好地观察对于HIV感染而言至关重要的两个步骤 。他们也发现病毒的衣壳（capsid）在这两个步骤中扮演的全新角色 。
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作为一种逆转录病毒，HIV能将自己的病毒RNA基因组逆转录为双链的DNA，并整合入所感染细胞的基因组内 。过去几十年，科学家们通过一系列结构、生化、以及分子病毒学的分析，已经阐明了参与这些步骤的多个酶反应 。但由于这些病毒颗粒深藏于细胞质与细胞核中，很难对其进行机制上的研究 。这也是为何科学家们想要开发一个“无细胞”的体系 。
先前，也有一些体外实验可以研究逆转录，或是整合的步骤，但这些实验一次只能观察一个步骤 。而在本研究中，科学家们设计和优化的体系可以连续观察这两个步骤 。
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连续观察HIV-1基因组逆转录和整合的体外无细胞体系
具体来看，他们纯化了HIV-1病毒体，使用能穿孔的多肽，在病毒包膜上“打”了一些小洞 。随后，他们添加了一些dNTPs，促使逆转录的发生 。实验中，科学家们成功观察到了双链DNA的积累 。随后，科学家们往实验体系中添加了细胞提取物，重现了病毒DNA整合入外源DNA的过程 。测序结果确认病毒DNA整合的方式与预期一致 。
【IT|HIV研究迎来重要进展 最新《科学》揭示衣壳的重要作用】有意思的是，在确认哪些要素对于病毒的逆转录和整合起到关键作用的时候，一个意想不到的结果出现在科学家们面前——HIV的衣壳 。从结构上看，衣壳是包裹在病毒遗传物质外的一层保护 。但这篇论文发现，衣壳在病毒感染的过程中，起到了更为主动的作用 。
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HIV的衣壳（黄色和紫色所示）包裹着病毒的RNA（蓝色所示）（图片来源：参考资料[2]；Credit：Janet Iwasa）
通过遗传学或生物化学的方法，研究人员们发现，如果衣壳变得不稳定，病毒就无法通过逆转录来复制自己的遗传物质 。这也是科学家们首次直接表明，衣壳是HIV感染的重要元件 。
俗话说眼见为实 。为了看清衣壳如何参与到了HIV感染的过程，研究人员们使用冷冻电镜技术，看到在逆转录的过程中，衣壳大部分都保持完整 。在逆转录发生的8-10个小时后，研究人员们依旧可以观察到大型的完整衣壳结构，且病毒的核酸从衣壳的网状晶格结构中排出 。这一时间段恰好是逆转录产物积聚到峰值，发生整合的时间 。
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冷冻电镜和分子建模技术让我们有机会以前所未有的细节看清病毒（图片来源：参考资料[2]；Credit：Owen Pornillos，Barbie Ganser-Pornillos）
“这和教科书上写的不一样，”本研究的通讯作者之一Wesley I 。Sundquist教授说道，“我们的数据显示病毒的衣壳在支持有效的逆转录方面，扮演了主动且不可或缺的角色 。”
研究人员们指出，这项研究在无细胞的体系中重塑了HIV的逆转录和整合，并表明病毒的衣壳在其中起到了重要的作用 。与先前的理解不同，它不仅能保护病毒基因组，让病毒跨越细胞质，进入细胞核，接近整合位点，它还是逆转录过程的关键 。
对于针对衣壳蛋白的在研HIV药物来说，这项研究表明它们可能起效 。而这个无细胞体系的建立，也有助于未来对HIV感染的关键步骤进行更详尽的研究，找到阻止HIV的全新方法 。


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