|蛋白质兼具可塑与稳定性?从进化视角揭示生命复杂系统的内在平衡



|蛋白质兼具可塑与稳定性?从进化视角揭示生命复杂系统的内在平衡
本文插图

导语
在生命复杂系统中 , 有的变量表现出稳定性 , 而另外一些变量表现出可塑性 , 它们之间存在微妙的平衡 。 近日东京大学综合文化研究科博士后、集智科学家傅渥成(唐乾元)等 , 在Physical Review Research发表文章 , 揭示蛋白质系统的功能敏感性和突变稳定性之前的定量关系 , 加深了对蛋白质功能运动和突变进化之间的关系 。
1. 可塑性(plasticity)和稳定性(robustness):矛盾还是互补?
生命系统常常表现出高度的“可塑性” , 这种可塑性反映出系统随环境变化状态“可变”的一种特性 。 当生物来到了一个新的环境 , 常常可以很快地适应新的环境 , 这就是一种可塑性;再比如说 , 我们的大脑可以不断学习新的知识 , 这也是一种可塑性;通过选择与进化 , 生物变得越来越适应某种环境 , 这也可以看成是一种可塑性 。
与可塑性相反的一个概念是稳定性(robustness , 平时也翻译为鲁棒性、稳健性等 , 本文为简单起见 , 统一称为“稳定性”) 。 例如 , 恒温动物的体温在不同的环境下可以保持在相对稳定的范围内 , 这体现的就是一种稳定性 。 稳定性所反映的是系统随环境变化状态“不变”的一种特性 。 可塑性与稳定性 , 代表着复杂系统“可变”与“不变”这样一个基本矛盾 。
一个系统 , 通常要么是具有可塑性 , 要么是具有稳定性 , 很难同时实现这二者 。 当然 , 在复杂系统中 , 通过一些精巧的平衡 , 系统可以同时具有可塑性和稳定性——我们的大脑既可以学习崭新的知识(可塑) , 又能保持那些古老的回忆(稳定) 。 更多的 , 我们常常会看到 , 在一个复杂系统中 , 有的变量表现出稳定性 , 而另外一些变量表现出可塑性 。
这种现象其实在经典的热力学中经常出现 。 热力学中有许多共轭的变量 , 例如体积和压强 。 当两个变量互为共轭的时候 , 增大其中一个量的可变性 , 实际上就是在增大其共轭变量的稳定性 。 例如 , 在一个化学反应中 , 如果我们固定系统的压强(等温等压系综) , 系统的体积则有可能会发生剧烈的变化 , 反过来 , 如果固定体积 , 那么压强又会有剧烈的变化 。 总之 , 体积的可变性跟压强的稳定性可以同时实现 , 而压强的可变性跟体积的可变性也可以同时实现 。 从直观上来看 , 看起来有点像量子力学的“不确定关系” 。
在生物系统的适应性等问题中 , 这种类似的共轭关系也广泛存在 , 举个例子 , 在一个振动问题中 , 相位和频率也有类似的共轭关系 , 因此 , 相位的可变性跟频率的稳定性是可以同时实现的 。 这很好理解 , 当我们从一个时区移动到另一个时区 , 我们很快便适应了这个新时区的生活 , 这里 , 我们所适应的 , 其实就是新环境下的“相位” , 而在新的时区 , 仍然每天是24个小时 , 即频率保持稳定 , 相位可以调节[1] 。 试想在未来 , 人类(或者其它生物)需要经常在昼夜时长不同的星球上生活 , 到那时 , 我们或许会更想要相位保持稳定、而频率保持可变的生物钟 。
总之 , 尽管“可变”和“不变”无法同时实现 , 但是在一个复杂系统中 , 可塑性和稳定性未必总是矛盾的 , 我们常常可以看到 , 系统的某一部分具有强的可塑性 , 而另外一部分变量保持高的稳定性 。 特别的 , 当两组变量互为共轭的时候 , 增强其中一部分变量的可塑性 , 实际上可以帮助提高与之共轭的一部分变量的稳定性 , 反正亦然 。 沿着这一思路 , 我们近期在Physical Review Research 上发表了一篇理论研究的文章 , 这篇文章描述了蛋白质的功能敏感性和突变稳定性之间的关系 , 这一关系同样体现了可塑性与稳定性之间的互补性 。 在这篇文章里 , 我将简要概述一下文章的主要思路 , 如果你对相关的细节感兴趣 , 可以直接阅读我们的论文[2] 。


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