新冠首个新冠病毒刺突蛋白全原子开源模型问世
【新冠首个新冠病毒刺突蛋白全原子开源模型问世】
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一种刺突蛋白模型 。 图片来源:物理学家组织网
科技日报北京6月23日电 (采访人员刘霞)刺突蛋白在新冠病毒进入人体细胞中起关键作用 , 使其成为新冠肺炎疫苗和抗病毒药物开发的主要靶标 。 据物理学家组织网22日报道 , 一个国际科研团队近日创建了首个刺突蛋白全原子开源模型 , 研究人员称 , 科学家们可利用最新模型 , 针对新冠肺炎防治方法开展富有创新性的模拟研究 , 从而促进疗法和疫苗的研发进度 。
来自韩国国立大学、英国剑桥大学和美国理海大学的研究人员携手开发了最新模型 。 研究发表于最新一期《物理化学B杂志》 。
刺突蛋白是新冠病毒用来与受体结合的主要表面蛋白 , 当刺突蛋白与人类细胞受体结合后 , 病毒膜与人类细胞膜融合 , 使得病毒基因组得以进入人类细胞并开始感染 。
研究人员用冷冻电镜测定了刺突蛋白的结构 , 但这一模型有许多丢失的氨基酸残基 。 因此 , 他们首先对缺失的残基进行建模 , 然后对其他缺失的域进行建模 。 此外 , 他们也对附着于刺突蛋白的所有潜在聚糖(或碳水化合物)进行了建模 。 这些聚糖会阻止抗体识别出刺突蛋白 , 加大疫苗研发的难度 。 他们还创建出了刺突蛋白的病毒膜系统 , 用于分子动力学模拟 。
里海大学生物科学和生物工程学系教授尹元弼(音)说:我们的模型是首个完全糖基化、全链新冠病毒刺突蛋白开源模型 , 科学家可以使用我们的模型 , 针对新冠肺炎防治方法开展富有创新性的模拟研究 。
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