疫情中发挥重要作用的「宏基因组测序」，在本季度获得资本追捧我国科研单位在一

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作者：许梦翘

来源：IT桔子（itjuzi521）

基因测序技术在此次疫情中起到了至关重要的作用，我国科研单位在一个月之内迅速发现了正确的致病病毒并完成测序，得到了 WHO「创纪录短的时间」的赞许。我国科学研究者对病毒序列、变异、核酸检测手段的分享也为全世界应对 COVID-19 疫情带来了极有力的支持。

在病毒检测过程中，一种测序技术获得了市场的广泛关注，这个技术就是宏基因组测序（mNGS）技术。宏基因组学（Metagenomics），是以特定环境样品中整个微生物群落基因组作为研究对象，无需分离培养，直接提取环境样本的 DNA 进行高通量测序。对于临床而言， mNGS 可以精准的分析患者样本全部微生物，这一点对于感染性疾病的病原体研究具有极高的应用价值。

尤其是在未知传染病的病原体检测方面，传统的体液培养等检测方式整体效率、阳性率低下， PCR 检测也局限于已知的病原微生物基因序列，能够精准分析病原体并能够高通量测序的 mNGS 具有强大的优势。 mNGS 的这两大优势也令其在这次新冠肺炎的病毒检测中发挥出色。

一些是上市公司在此次疫情中采用了宏基因组测序技术，比如华大基因，该公司早在 2010 年便采用宏基因组测序这一新型测序手段对当时国内爆发的新布尼亚病毒。另外一家上市公司贝瑞基因在此次疫情中也研发的新型冠状病毒试剂盒，基于其第三代单分子测序技术平台（PacBio 技术平台），也可一次完成 96 人份样品的病毒宏基因组测序。

宏基因组测序在一年多的时间里也受到了资本市场的广泛关注，疫情发生之后，全球宏基因组测序市场又有多家公司在本季度获得投资。

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Karius

Karius 成立于 2014 年，是一家专注于微生物 mNGS 测序技术的公司。该公司 2 月 24 日宣布已获得软银愿景基金领投的 1.65 亿美元的 B 轮融资， General Catalyst 和 HBM 以及现有投资者 Khosla Ventures 和 LightSpeed Venture Partners 也参与了此次融资。

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Karius 历史融资（来源：IT 桔子 itjuzi.com）

该公司使用全自动设备处理标本，该设备可以从血浆中分离微生物无细胞核酸（mcfDNA），使用特有工艺去除不必要的人类 DNA ，然后对样本进行测序，并使用机器学习等手段对数十种实时数百万个数据点来识别匹配项。这种核酸是病原微生物在血液中留下的「痕迹」，通过对这些痕迹进行测序，便可以分析出感染的病原情况。该技术可以识别和量化 1250 种临床相关的病原菌，包括细菌、真菌和寄生虫等。