疫情中发挥重要作用的「宏基因组测序」,在本季度获得资本追捧( 二 )
【疫情中发挥重要作用的「宏基因组测序」,在本季度获得资本追捧】2019 年 2 月 Karius 在 Nature Microbiology 发表名为「Analytical and clinical validation of a microbial cell-free DNA sequencing test for infectious disease」的研究结果 。 该研究将 Karius 测试的功效与传统病原体检测手段进行了对比 , 结果表明 Karius 的基于 mcfDNA 宏基因组测序对病原体的识别速率比普通血液培养快三倍 , 同时测试结果高度准确对于每微升血浆中仅贡献 50 个 cfDNA 片段的生物 , 分析灵敏度就高达 95%以上 , 每种病原体的分析特异性也高于 99.99% 。
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Karius 测试工作流程
杰毅生物
杰毅生物近日宣布完成近亿元人民币 Pre-A 轮融资 , 投资方包括比邻星创投、普华资本和体外诊断资深产业人士等 。 资金将用于病原宏基因组 mNGS 相关设备及试剂盒的注册报证、检测服务网络建设等 。
杰毅生物由贝瑞基因创始团队成员王珺博士和浙江大健康产业基金原合伙人钟杰先生共同发起成立 , 公司围绕基因编辑(CRISPR/Cas)和高通量测序(NGS)两大前沿技术路线 , 自主研发了一系列病原宏基因组 mNGS 自动化检测仪器和研策试剂 。
该公司在今年 2 月中旬与阿里云签订合作协议 , 将基因测序技术与 AI 技术交叉融合 , 全面研究并推动病原微生物宏基因组在感染性疾病检测领域的临床应用 , 利用云计算的优势降低流程时间 , 提高数据分析的速度 。
疫情期间 , 杰毅生物完成了武汉金银潭医院本地化宏基因组测序中心的搭建 , 该中心配备的 Illumina 高通量测序仪和杰毅生物自主研发的病原宏基因组一体化建库仪 , 可实现送检的样本放入生物安全柜中自动运行 , 将原本十几个小时的手工操作 , 缩短到 2 个小时全自动无人值守完成 , 再通过高通量测序进行检测 , 在 16.5 小时内 , 检测覆盖细菌、真菌等 16000 多种病原体 。
予果生物
2020 年 2 月 25 日 , 予果生物完成来自北极光创投的天使轮投资 , 之后产业基金、金融机构对其持续注资 , 累计融资近亿元 。 本轮融资将用于开拓和教育市场、扩充团队、试剂盒报证以及持续投入更多新产品研发 。
予果生物成立于 2017 年 , 专注于微生物核酸检测 , 专注于将宏基因组技术应用于病原感染诊断 。 该公司先后在北京、西安、广州、南京建立了微生物基因技术检测中心、医学检验所、交付中心 。 基于其自主研发的云端病原微生物数据分析系统 PACE(Pathogen Capture Engine) , 予果生物可对脑脊液、血液、肺泡灌洗液、无菌体液、组织等临床样本进行病原微生物 DNA 及 RNA 序列测定 , 能够快速、准确、客观地检测出临床样本中的多种微生物 , 无需培养或特异性扩增 。
目前予果生物已为全国超过 300 多家三甲医院提供临床检测、筛查、咨询服务 。 并且在运用宏基因组测序方法检测的样本量位居全球前列 , 样本总数居国内第二 , 其中脑脊液检测量位列全球前二强 。
除了传染病的应用场景之外 , 利用 mNGS 还可以对菌群进行菌株鉴定分型、耐药基因与毒力基因的检测 , 适用于抗感染治疗、院内感染管理的评估 。 在越来越多的证据表明微生物对人体免疫系统能够产生影响 , 以及微生物菌群会参与到神经退行性疾病、糖尿病等疾病的发生发展当中 , 微生物疗法获得了越来越多的关注 , 而 mNGS 未来也可以为人们深入分析人体菌群微生态、研究微生物疗法提供一种可靠的技术手段 。
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