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新冠病毒被正式命名为SARS-CoV-2( 二 )


关于新冠病毒命名 ， 都是由国际病毒分类委员会的冠状病毒研究组(CSG)执行的 ， 该研究组是国际病毒分类法委员会(ICTV)的工作组 。 CSG 负责通过评估病毒与已建立分类单元中已知病毒之间的关系来评估病毒的新颖性 ， 就本文而言 ， 特别是在与严重急性呼吸综合征相关的冠状病毒物 种的背景下 ， CSG 负责评估病毒的新颖性 ， 并且将新的病毒进行命名 ， 成为 WHO 引用病毒的命名 。新冠病毒和新冠肺炎之间命名来源区别目前 ， WHO命名的是病毒所感染的疾病 ， 而也就是说 ， WHO命名的是病毒所感染的疾病名称 ， 而CSG是对病毒本身的统一性命名 。事实上 ， 这一命名背后 ， 是有着复杂的鉴定、规范性流程的 。 根据论文所述 ， 要了解与严重急性呼吸系统综合症相关的冠状病毒和SARS-CoV之间的区别 ， 即物种与病毒之间的区别 ， 需要新冠病毒在几种冠状病毒下进行测试观察 ， 研究它们之间的关系 ， 以及病毒宿主来源之间的区别 。在观察时 ， CSG研究人员发现 ， 新冠病毒的基因组序列与 SARS-CoV-Urbani 是同一个 ， 尽管新冠病毒与 SARS 病毒本身不同 ， 但是这种与之平行 ， 超出了新语境 ， 并且具有生物学意义 ， 尽管该概念在病毒学中的扩展尚待开发和全面测试 。CSG使用了比较基因组学的计算框架 ， 用专门知识和工具来评估个体之间的差异 。 该框架由与 Nidovirales 顺序的分类和命名有关的几个研究组共享 ， 并由 Nidovirales 研究组进行了协调 。 研究小组量化并划分了冠状病毒基因组的开放阅读框中编码的最保守的复制蛋白的变异以鉴定划分成对的阈值不同级别的病毒簇 。研究过程中 ， CSG科研人员发现 ， 严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒和 Beta 冠状病毒属物种中的 SARS-CoV-2 与 SARS-CoV 簇聚 ， 而在不同的研究中 ， 尽管 SARS-CoV-2 与最紧密相关的冠状病毒之间的距离估算值会有所不同 ， 具体取决于测量方法(核苷酸或氨基酸)的选择和基因组区域 。 但两者之间 ， 是存在一定联系的 。新冠病毒被正式命名为SARS-CoV-2
因此 ， 研究人员对包括 2505 种冠状病毒的数据集进行合并分析时发现 ， 2019 新型冠状病毒（2019-nCoV）可以被指定为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒 ， 也就是SARS-CoV-2 。 并且 ， CSG认为 ， 该物种的已知病毒的基因组变异与其他相对良好采样的物种（例如 ， 由 MERS-CoV ， HCoV-OC43 和 IBV 原型化的病毒）相比 ， 差别较小 。根据该物种中病毒命名的惯例以及物种树和距离空间中 SARS- CoV-2 与原型 SARS-CoV 的相对较远的关系（图 2B 和 4） ， CSG 重命名为 2019- nCoV 到 SARS-CoV-2 。而严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒物种的这两个特征都有助于将 SARS-CoV-2 明确分配给该物种 ， 对其后续研究有帮助 。由SARS-CoV-2引发的疾病被命名为COVID-19以上结果表明 ， 就分类学而言 ， SARS-CoV-2 是(仅)严重急性呼吸综合征相关冠状病毒物种中的另一种病毒 。 在这方面 ， 该病毒的发现与21世纪引入人类的其他两种人畜共患冠状病毒 SARS-CoV 和 MERS-CoV 的描述有很大不同 。 根据两个非正式物种的原型 ， 该研究小组认为新的冠状病毒是冠状病毒属的一个亚类 。 这些病毒及其类群被赋予了新的名称 ， 其来源反映了相应时间的实践和病毒分类的状态 。与 SARS-CoV 相比 ， SARS-CoV-2 的名称并非源自SARS疾病的名称 ， 并且绝不应该使用它来预先定义疾病的名称(或谱图)由人类 SARS-CoV-2 引起的疾病 ， 这将由 WHO 决定 ， 也就是新命名的 COVID-19 。SARS-CoV-2 的可用流行病学和临床数据有限 ， 表明该病毒和 SARS-CoV 的疾病图谱 ， 传播方式可能有所不同 。 同样 ， 用于确认 SARS-CoV-2 感染的诊断方法与 SARS-CoV 的诊断方法也不相同 。 这反映在针对 SARS-CoV-2 / 2019-nCoV 的针对公共卫生从业者 ，医护人员和实验室诊断人员的具体建议中 。 通过将新型冠状病毒与其他人类与动物之间引起的疾病名称区分开来 ， CSG 希望以最适当的方式帮助 WHO 命名病毒 。为了促进良好实践和科学交流 ， CSG 建议研究人员描述该病毒和该物种中其他病毒的新分离株时 ， 采用新的命名法则 。 为了促进通信 ， CSG 还建议对单独的新冠病毒隔离株使用以下命名：SARS-CoV-2 /隔离株/宿主/日期/位置 ， 但与人类 SARS-CoV-2 感染相关的临床表现谱还有待确定 。新冠病毒与SARS之间的区别与联系这一次新的命名 ， 尽管在论文当中 ， CSG 表示新冠病毒与 SARS 病毒并不相同 ， 种型不一致 ， 但与李文亮最早提出的“SARS"、"隔离“等说法不谋而合 ， 从上面论文叙述看 ， 两者也都是十分相近的病毒类型 ， 存在一定联系的 。一个月前的12月30日17时48分许 ， 李文亮在一个150人左右的同学群中发布信息称：“华南水果海鲜市场确诊了7例SARS ， 在我们医院急诊科隔离” 。根据国家卫健委最新发布的《新型冠状病毒感染的肺炎的诊疗方案（试行第五版修订版）》与2004年发布的《传染性非典性肺炎（SARS）诊疗方案（2004版）》相比 ， 新冠肺炎在预防、检测、治疗等场景的手段 ， 与17年前的 SARS 极为相似 ， 在央视报道中 ， 也多次用“17年前的宝贵经验”等词语 ， 对这次疫情进行表述 。在临床上 ， 都使用（广谱）抗病毒药物 ， 都使用糖皮质激素 ， 严重病患就需要上 ECMO ， 一切都如此相似 。但是 ， 由于新型冠状病毒传播路径一直无法完全确定 ， 让两者在其他部分存在未知 ， 也是这次命名上的一个挑战 。新冠病毒的临床特征包括以发热、乏力、干咳为主 ， 少数患者伴有鼻塞、流涕、腹泻等症状 ， 潜伏期一般是 1-14 天之间 ， 在潜伏期之间就会传染且发病 ， 潜伏期内无症状也会有传染发病危险 ， 传播形式主要包括飞沫直接传播、接触传播等 。 根据钟南山所领衔的论文当中表明 ， 新冠肺炎发热并不明显 ， 胃部残留病毒 ， 粪口、气溶胶传播尚不明确 。而 SARS 的临床特质主要以持续性高热为主 ， 可伴有畏寒、肌肉酸痛、关节酸痛、头痛、乏力 。 部分病人出现腹泻、恶心、呕吐等消化道症状 。 SARS的潜伏期通常限于2周之内 ， 一般约2～10天 ， 潜伏期无症状不发病 ， 只要有了症状就会大范围传染 。 传播途径包括飞沫、接触、气溶胶和粪口传播 ， 血液传播等尚不明确 。一般来说 ， SARS 临床上是“起病急” ， 而新冠病毒属于“自愈性” ， 充分是要考虑自身抵抗力 ， 尽管病毒死亡率低于 SARS ， 但传染力要远远高于 SARS 。事实上 ， 这次提出的新命名将对于随后的流行病学和其他研究以及控制措施至关重要 。 无论如何 ， 病毒（疾病）的命名目的是更利于世界各国的疫情研究、防治沟通 。或许这次之后 ， 新冠病毒整体防治工作 ， 会有一个新的方向 ， 与SARS结合 ， 为尽快打赢疫情攻坚战做着科学化的努力 。 （本文首发钛媒体 ， 作者/林志佳）


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