【病毒】武汉病毒所是疫情源头?学者呼吁不要凭空假设( 二 )


周鹏当时提到 , "我们目前的结论是 , 后来在蝙蝠中发现SADSr冠状病毒可能是病猪中发现的这个新病毒SADS冠状病毒的祖先 , 但同样直接来源于蝙蝠中的HKU2冠状病毒和SADSr冠状病毒可能来源于一个祖先 。 "
研究团队当时在论文中还将SADS和SARS联系在了一起 。 两者起源地不远、源头均为菊头蝠 , 而且"在实际操作中 , 我们发现在同一只菊头蝠中同时携带了SARS样冠状病毒和这次猪病的病毒 。 而冠状病毒重组很厉害 , 就像搭积木一样 , 我的模块放在你那里 , 你的模块放在我这里 , 说不定将来重组成什么 。 "
不过 , 不同于SARS的是 , 研究团队新发现的SADS冠状病毒截至论文发表时并未发现会致人死亡 。
论文中当时提到 , 为调查可能存在的人畜传播 , 研究团队用抗体检测方法分析了35名近距离接触病猪的养猪场工作人员的血清样本 , 结果没有人呈SADS冠状病毒阳性 。
值得一提的是 , 周鹏接受采访时同样提到冠状病毒"善于重组" , 这就暗示SARS样冠状病毒和这次猪病的病毒或有发生重组的几率 。 "就冠状病毒的重组历史来说 , 完全有这种可能 。 并且如果是在同一只蝙蝠中或是在同一个山洞里的蝙蝠同时携带两种病毒 , 也会增加重组的可能性 。 "
石正丽当时也表示 , "通过这项工作想提示一下 , 无论是养殖业还是公共卫生 , 我们都要提前去预防由这些野生动物传到人类社会的这些病原 。 其实这些病原在自然界是长期存在的 , 只要我们对这些病原进行早期的隔离、预防 , 或是早期诊断技术 , 是完全可以避免这样的传染病大规模爆发的 。 "
她提到 , "尤其在SARS爆发以后 , 我们国家、包括全球 , 大家都有一个共识 , 希望把新发传染病的战线往前移 。 "
实际上 , 包括石正丽等团队在内的病毒学家们 , 他们历年的学术论文 , 不仅体现出在马不停蹄应对各地新发的传染病 , 也体现出他们试图找出更多关于病毒的规律 , 为下一场未知的疫情做准备 。 尽管这样的准备在实战时往往被认为收获甚微 , 因为病毒的"狡猾性"至今让人类处于下风 。
印度论文称病毒是人为拼接并有HIV病毒片段 , 遭同行恶评已撤稿
如果说"新冠病毒早就出现"的猜测只是出于部分没有专业知识的群体 , 那么生物预印本网站bioRxiv在1月31日上线的一篇论文则引发了一波学术界讨论 。
bioRxiv是一个免费的在线档案和分发服务 , 用于生命科学中未经发表的预印本 , 由非营利性的知名研究实验室--美国冷泉港实验室(CSHL)运营 。 一般而言 , 预印本是科研论文的完成草稿 , 由作者上传到公开的资料库 , 如果论文后续还有经过修改 , 也可以继续上传 , 但旧的版本会继续存在 , 在预印本发表后的论文依然可以向期刊投稿 。
值得注意的是 , bioRxiv在线发布预印本之前 , 文章不经过同行评审、编辑或排版 。
这篇论文出自印度德里大学和印度理工学院的研究团队 , 他们对比了新冠病毒和SARS的刺突蛋白序列 , 发现新冠病毒的刺突蛋白比SARS病毒的同源蛋白上多出来了4个独立的短肽段(6-12个氨基酸左右) 。 作者由此指出 , 多出来的4个短肽段是新冠病毒独有的 , 其他冠状病毒没有 。
在数据库中比对搜索之后进而得出结论:这4段多出来的短肽段和HIV-1中的gp120和Gag蛋白高度相似 。 作者认为这一切并非偶然 , 通过一些结构3D模拟 , 他们猜测这些多出来的短肽段可能对新型冠状病毒与其受体的结合有关 。
尤其引发外界猜疑的是 , 印度团队在论文摘要中指出"这不太可能在自然界偶然发生" , 在结论部分再次写道 , "新冠病毒棘突蛋白与HIV-1gp120和Gag蛋白不寻常的相似性不太可能是偶然现象" 。
这篇论文令外界的一些阴谋论者直接认为新冠病毒"源自实验室" 。
但这篇文章很快被其他专业学者批驳 。 美国华盛顿大学医学系和基因组科学系副教授、Fred Hutchinson癌症研究中心生物信息学专家Trevor Bedford在推特上公布了自己重复比对的结果 , 他确认这些短插入序列确实存在于新冠病毒中 , 但是这些插入序列与相当多物种的序列都能匹配 , 其中大部分甚至不是病毒 。 印度学者声称独有的HIV病毒蛋白根本不在序列对比排名的前列 。
【【病毒】武汉病毒所是疫情源头?学者呼吁不要凭空假设】华中科技大学生命科学与技术学院生物医学工程系教授薛宇在接受澎湃新闻采访人员(www.thepaper.cn)采访时表示 , 他不认为新冠病毒来源于实验室 。 2月5日下午 , 薛宇在科学网博客上也详细阐述了其个人观点 。
【【病毒】武汉病毒所是疫情源头?学者呼吁不要凭空假设】薛宇认为 , 在各种各样的质疑新冠病毒可能源自实验室的文章 , 水准最高的是美国纯净和应用知识研究所(Institute for Pure and Applied Knowledge ,IPAK)的创立者及首席执行官Dr 。James Lyons-Weiler在网上贴的两篇英文的技术贴 。
薛宇称 , "他猜测源自实验室 , 最主要的证据是发现了一段仅在新冠病毒中存在 , 而其他病毒中不存在的长度为1378bp的插入片段 , 也就是他定义的INS1378 。 他后面所有的推测 , 都基于这个前提 。 "
"我做的事情 , 是把他提供的这段序列提交到数据库里 , 发现INS1378在许多的冠状病毒里都存在相似片段 , 那就表明这段序列不是新冠专属的 , James根据这个片段做得所有推测就都不成立了 。 "薛宇表示 。


推荐阅读