生科医学|中国疾控中心披露检出奥密克戎变异株细节:波兰17岁女学生

12月13日,天津报告发现了我国内地第一例新冠病毒奥密克戎变异株,次日广州也发现了一例奥密克戎阳性病例 。
最新公布的《中国疾病预防控制中心周报(英文)》,第一次披露了我国首次检出奥密克戎变异株的具体情况 。
根据通报,12月9日,两名国际旅客从波兰华沙飞抵天津滨海国际机场,核酸检测结果确定为新冠病毒无症状感染者 。
第一个病例(患者A)是一名机组人员,35岁,男性,12月10日乘坐同一航班返回华沙,已于5月25日接种新冠疫苗,但已离开中国,缺乏进一步信息 。
第二个病例(患者B)是一名17岁的女学生,转移到海河医院隔离,已于9月27日接种辉瑞BNT162b2新冠疫苗 。
二者都是近期居住在华沙的波兰籍人员,经调查没有疾病症状、用药史 。
天津市疾控中心12月10日采集两例感染者的呼吸道标本,进行新冠病毒全基因组测序和序列分析,12月13日获得测序结果 。
与武汉发现的新冠病毒相比,患者A的病毒核苷酸序列有58个替换,39个缺失,9个插入(基因组覆盖率99.62%),菌株属于Pango系BA.1,别名为B.1.1.529.1 。
由于低病毒载量,患者B病毒基因组的覆盖率仅为92.62% 。根据检测到的50个替换和3个缺失的特点,菌株属于B.1.1.529 。
从患者A和患者B菌株的刺突蛋白中分别检测到40个氨基酸突变位点、至少26个氨基酸突变位点 。
受体结合域和furin蛋白酶切位点附近的一些突变,可能与免疫逃逸增强或传染性增高相关 。
初步实验数据表明,奥密克戎变异株显示出对新冠疫苗的免疫保护降低,并且在多个国家都显示出了更快的增长趋势 。
截至2021年12月14日,已有55个国家在全球共享流感数据倡议组织(GISAID)上传了4265个奥密克戎基因组序列 。
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生科医学|中国疾控中心披露检出奥密克戎变异株细节:波兰17岁女学生
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