行业互联网,超级计算机|重器，未来重大科研进展在这里孕育
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中国科学院广州生物医药与健康研究院同事眼中的“三剑客”正在讨论问题
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中国科学院超算环境广州分中心一角 黄博纯供图
在一间普通的机房里 ， 隐藏着雷霆万钧的“大家伙” 。这些宝贝被精心呵护 ， 科学家通过它们 ， 破解生命科学、新材料、新能源等领域不可或缺的重要密码 。
位于中国科学院广州生物医药与健康研究院（以下简称广州健康院）内的中国科学院超算环境广州分中心（以下简称超算中心）凭借以计算能力在干细胞与再生医学、创新药物设计、公共健康、海洋气象、地球科学、环保能源新能源等领域都有广泛的应用 。
“过去一年来 ， 超算中心支撑干细胞先导专项、国家重点研发计划及省市专项项目超过200项 。”超算中心主任陈朝明表示 ， “在2019年的指数排名中 ， 该中心在中科院各超算分中心中位列第一名 。”
“我们就是一个湖泊”
超算中心重点不在“超”而是擅长“算” ， 数据分析支撑科学研究 。成立时间虽短 ， 超算中心持续面向全院师生开展常用分析语言和方法的培训 。截止2020年9月 ， 面向中科院广州分院各研究所、生物岛实验室、高校及广州科学城相关企业等开通账号357个 ， 培训应用账号90个 ， 集群平均使用率达65% 。
“从超算资源量来讲 ， 如果把天河二号比喻为大海 ， 那我们就是一个湖泊 。”陈朝明如是说 。超算中心于2014年正式获得中科院批准、依托广州健康院建设和管理 ， 目前集群拥有：60台普通刀片计算节点 ， 1000个CPU计算核心 ， 全系统内存容量6TB ， 存储总容量达到3PB ， 整体聚合计算能力理论峰值达每秒100万亿次 。
超级计算机被称为“国家重器” ， 属于国家战略高技术领域 ， 也是世界各国竞相角逐的科技制高点 。目前 ， 超算中心主要应用在生物学、基础医学、 生物医学工程、药学等13个领域 ， 用户覆盖30个科研组左右 ， 最多时有超过100名分析人员同时在线进行计算 。
“生物学实验、尤其是药物研发 ， 涉及的数据量大、算力要求高 ， 基于AI技术构建完整的生物医药计算平台 ， 对于健康数据管理、理性药物设计等科研活动具有极大的价值 ， 高效稳定的网络和数据支撑也是重中之重 。”广州健康院研究员刘劲松说 ， “做好每个细节是作为实验支撑平台的责任与担当 。”
“三剑客”的故事
不同的学科背景 ， 为了共同的目标 ， 广州健康院研究员刘劲松、许永与陈朝明成为了同事口中的“三剑客” 。
超算中心建立之初 ， 由于经费紧张和大家对超算认识的不足 ， 三剑客采取“化缘”的方式 ， 号召院领导及PI ， “有钱出钱 ， 有力出力 ， 没钱没力出吆喝 。”终于在中科院、广州健康院的大力支持下 ， 采取“经费支持＋服务先租后购＋课题组支持” 的方式 ， 超算中心才得以建成 。
该中心建成后 ， “三剑客”仍然对其日常运维和未来发展倾注了大量精力 ， 像对待自己的孩子一样 ， 呵护有加 。有一次 ， 广州健康院内突然停电 ， 他们不约而同 ， 第一时间到达超算机房 ， 检查服务器、存储系统 ， 确保设备安然无恙 。随着广州健康院科研实力和人才队伍的不断壮大 ， 超算资源也面临诸多挑战 。
“依靠平台的专业技术支持 ， 在小实验室 ， 也可以做大科学 。我们相信 ， 未来重大的科研发现和创新 ， 可以从这里开始孕育、诞生 。”这是“三剑客”对超算中心的定位 ， 也是他们的笃信 。
中国科学院计算机网络中心研究员金钟表示 ， 广州健康院高度重视超算对科研创新的驱动 ， 连续几年在超算发展指数中位于中科院前列 ， 基于该超算分中心 ， 产出了一大批重大科研项目及重大成果 ， 培养了一大批生物医药计算交叉学科人才 。
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