医世象融合基因:是致癌魔鬼,亦是治癌天使


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精准检测辅助精准医疗 , RNA-NGS用于融合基因检测能为医生提供更多诊疗信息 , 让更多癌症患者获益 。
世界卫生组织统计数据表明 , “癌症已成为全球第二大死因 , 近1/6的死亡是由癌症造成的” 。 预计到2025年 , 全球每年新增癌症病例数将高达2449万例 。 癌症的高发病率主要源于人们的日常不良生活习惯 , 如较少的摄入果蔬、缺乏锻炼和过度吸烟饮酒等 。
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癌症新增和死亡病例中 , 亚洲占比都超过欧美 。 WHO指出 , “近70%的癌症发生在低收入、中等收入国家” 。 此外 , 高龄人群成为癌症发病率和死亡率的“重灾区” 。 在全球总人口的最新癌症发病率排行中 , 肺癌的发病率和死亡率都排在了首位 。
新时代的肿瘤基因检测
传统的常规肿瘤诊疗过程包括医生对患者进行肿瘤影像学检查后确定病灶位置 , 然后通过手术或穿刺获取病理组织再进行病理学活体组织检测 , 根据活检结果和经验制定诊疗方案 。
肿瘤基因检测出现后 , 医生可以对肿瘤或含有肿瘤分子标志物的体液(血液、脑脊液)进行无创检测 , 直接获取肿瘤的基因图谱或突变位点信息 , 这成为临床医生使用靶向药的重要依据 。 肿瘤基因检测直接反应不同患者间的个体化差异 , 实现个性化的精准治疗 。
基因检测技术经历了分子杂交技术、PCR技术和生物芯片技术的不断迭代发展 , 高通量测序技术和生物信息学的发展将基因检测技术推向了新时代 , NGS已经深入到肿瘤早筛、易感基因检测、分子分型、预后判断和疗效监控等肿瘤诊疗的各个阶段 。
融合基因如何实现精准检测
总的来说 , 癌症是正常细胞由于基因突变造成异常增殖所引起的疾病 , 从本质上来说是一种基因病 。 常见的肿瘤基因突变包括点突变、基因片段插入缺失、拷贝数变异等 。
在众多基因突变类型中 , 有这么一类突变种类变化多端 , 假阴性率高 。 这便是我们今天要为大家介绍的融合基因(Gene Fusion) 。 它是指两个或多个基因的编码区重新排列组合 , 共同置于一套ORF阅读框中 , 既可以发生在DNA水平上也可以发生在RNA水平上 。
大多数情况下 , 融合基因可以导致序列异常、某些基因表达失调及蛋白质功能异常 , 从而导致或促进肿瘤的发生 。
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图源:https://ashpublications.org/blood
迄今 , 人们已经锁定了大约2万多个融合基因 , 但是它们在癌症发展中的确切功能和作用则知之甚少 。 因此 , 辨别融合基因是否与癌症病人的预后相关具有重要的临床意义 。
目前 , 融合基因的检测方法包括传统的荧光原位杂交(FISH)、PCR扩增技术(RT-PCR)、免疫组化(IHC)以及NGS等技术 。 每种技术都各有优劣势 。
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融合基因检测方法对比
在RNA水平上行NGS检测融合基因相较于DNA水平上天然存在各种优势 。 RNA水平融合的靶基因功能相关性更强 。
首先 , RNA水平上发现的融合基因在DNA水平上不一定存在对应的基因融合现象 , 行DNA-NGS检测或为阴性;其次 , RNA水平的基因融合更有可能翻译成蛋白质 , 更有可能影响肿瘤的发生发展;再次 , DNA水平上的基因融合可能是一种非常罕见的结构变异 , 而转录形成的RNA水平上的基因融合则较为常见 。
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