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「巴斯德研究所」巴斯德最新研究：法国疫情非中国输入引发

4月28日 ， 巴斯德研究所发布新闻公告 ， 该所已完成法国输入性与早期传播病毒的朔源分析相关研究 ， 研究结果于近日以预发表发布在bioRxiv.org网站 。
根据该研究 ， 法国暴发的新冠肺炎疫情并不是由1月份来自中国的输入病例引起的 ， 也并非来自意大利 ， 而是来自一种在当地传播的来源不明毒株 。 该研究由法国国家呼吸道感染病毒参考中心主任西尔维·范·德维尔和巴斯德研究所RNA病毒进化基因组学负责人埃蒂安·西蒙·洛里埃共同牵头 。
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根据巴斯德研究所提供的新闻稿 ， 继去年12月武汉市出现新冠肺炎疾病后 ， 法国于1月10日开始病毒监测 ， 由巴斯德研究所和法国呼吸病毒研究所（NRC）负责启动密切关注流程 。
法国于1月24日发现首例新冠病毒感染者 ， 这也是欧洲首例新冠肺炎患者 ， 另有其他两例中国输入性病人也很快被检测和收治 。 法国政府迅速采取措施 ， 追踪了这些患者的密切接触者 ， 阻止了病毒的进一步传播 。 1月份的中国输入病例没有在法国引发局部传播 ， 显示出法国采取预防病毒扩散系列措施的有效性 。
法国采集的新冠病毒样本均储存在国家呼吸病毒研究所 ， 巴斯德研究所RNA病毒进化基因研究组对97份法国病毒样本进行了基因测序与比对 。
样本主要为鼻咽拭子和痰液 ， 采样时间为1月24日至3月24日 。 法国该阶段确诊病例22302人 ， 死亡1100人 ， 疫情主要流行于法国北部 。
【「巴斯德研究所」巴斯德最新研究：法国疫情非中国输入引发】全部样本均采自于有临床症状的确诊患者 ， 同时将籍贯、旅行史、发病时间、病毒载量和采样部位纳入基因比对内容 。 另有3份来自阿尔及利亚病毒样本 。
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法国3月疫情主要地区分布图
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法国新冠肺炎样本单核酸多态性发生部位比较图
根据欧洲精准医疗平台首席科学家鞠丽雅对该溯源研究的解读 ， 图中显示：
1、取自法国东南部并有意大利旅行史的病毒株（GE1583 ， B2340）与法国北部的不同 ， 但和意大利北部流行株类似 ， 而且没有在法国流行；
2、法国首例武汉患者（IDF0372） ， 其单核酸多态性 G22661T是独有的 ， 与法国的所有病毒基因不同；
3、法国北部地区的代表性病毒基因为 GE1973 （东大地区） ，IDF2849（大巴黎地区） 和 N2223 （诺曼底地区）；
4、有欧洲旅行史的代表基因为 IDF2792；
5、3份取自阿尔及利亚的病毒株与法国北部流行株同源 。
巴斯德研究所将法国检测的样本序列与全球共享流感数据倡议组织（GISAID）发布的338份新冠肺炎病毒序列进行比对和溯源分析 ， 并建立病毒进化树图谱 。
对比研究表明 ， 法国流行的新冠病毒和1月发现的中国输入感染病毒并非来自同一毒株 ， 两种病毒来自同一个祖先 ， 但属于不同的分支 。 导致法国本地疫情的主流分支 ， 和来自中国和意大利的输入病例都不相同 。
法国现今流行的病毒样本中 ， 最早一个样本是2月19日从一名患者身上采集的 ， 该患者没有国内外旅行史 ， 也没有和海外归国的旅行者接触过 。 该患者于2月25日去世 ， 随后法国出现大规模疫情潮 。
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