江苏龙网

  1. 首页 > 人文 > >

「茅山科幻」算力=500台超级计算机，百万人贡献PC共同分析新冠“折叠蛋白”( 二 )


了解蛋白质结构 ， 将有助于开发抑制药物
通过对蛋白质运动结构的模拟 ， 可以寻找蛋白潜在的“药物结合点” ， 从而开发出可以抑制病毒蛋白质的药物 。
在Folding@Home的最新研究中 ， 他们模拟了一种来自埃博拉病毒的蛋白质 ， 这种蛋白质通常被认为是“不可受药”的 ， 因为实验中的蛋白质状态没有明显的可药物位点 。
「茅山科幻」算力=500台超级计算机，百万人贡献PC共同分析新冠“折叠蛋白”
文章图片
埃博拉病毒蛋白质的实验结构没有明显的药物作用位点（球状的原子间没有深的“口袋”）
【「茅山科幻」算力=500台超级计算机，百万人贡献PC共同分析新冠“折叠蛋白”】但是 ， Folding@Home通过计算机模拟发现了另一种结构 ， 确实有一个可药物的点 。 重要的是 ， 研究人员随后进行了实验 ， 证实了我们的计算预测 ， 目前他们正在寻找与这个新发现的结合位点相结合的药物 。
现在对于SARS-CoV-2研究的目的也是如此 。
现在 ， 这项研究已经得到了初步回报 。 GregBowman说 ， 他们的其中一项工作就是持续关注SARS-CoV-2用于入侵人类细胞的“刺突蛋白” ， 刺突必须经过剧烈的张口运动 ， 才能揭开细胞表层 ， 最终与人类细胞进行结合 ， 了解刺突究竟是如何打开的 ， 这会非常有用 ， 毕竟治疗过程中的每一个步骤都可能是针对性治疗 。
“然而 ， 至少以现有的实验技术 ， 我们还无法观察到刺突是如何发生这种变化的 ， 刺突张口状态的数据也很有限 。 ”但是仅仅几个星期之后 ， 这个团队就通过该项目创建出一个仿真模型 ， 模拟了刺突张开“嘴巴”的第一阶段 。
被比特币带歪的“全球共享分布式计算”项目
用强大的计算力对蛋白质的结构进行模拟显然是一个非常有意义的项目 ， 而号召全球的志愿者共享出自己的个人计算机 ， 更是彰显了人类在抗击疫情中的团结合作 。
但是这样的项目的生存空间却因为“挖矿”而越来越小 。
比特币和加密货币的兴起抑制了Folding@Home和类似项目的发展 ， 毕竟“挖矿”为空闲的个人计算资源提供了另一种不那么无私的用途：“开采比特币”就可以挣到真正的钱 。
就在Folding@Home发布Covid-19相关新任务的前不久 ， 分布式计算工作的先驱项目SETI@home被关闭 。
自1999年以来 ， SETI@home一直向世界各地的计算机发送射电望远镜数据 ， 然后对这些数据进行分析 ， 从而寻找外星生命的迹象 。 但是上个月 ， 研究人员关闭了该计划 。
SETI@home的组织者说：“管理数据的分布式处理对我们来说是个很麻烦的工作 。 我们现在需要集中精力对已有结果进行后端分析 ， 然后发布在科学期刊中 。 ”
相关报道：
https://www.theguardian.com/technology/2020/apr/15/volunteers-create-worlds-fastest-supercomputer-to-combat-coronavirus
https://www.theguardian.com/science/2018/dec/02/google-deepminds-ai-program-alphafold-predicts-3d-shapes-of-proteins
https://foldingathome.org/about/the-foldinghome-consortium/


推荐阅读


上一篇：「趣味科技」戴尔科技集团为远程办公计算机安全保驾护航

下一篇：[娱圈讲科技]唱吧精灵麦克风Q3上手体验，李佳琦同款，专业K歌神器