『新冠病毒』考古泰斗重建新冠进化图:三种类型,早期东亚地区病毒突变慢( 三 )


本文插图

安大略省患者的病毒位于系统发育网络B簇中 。 该患者从中国中部的武汉旅行到中国南部的广东 , 然后返回加拿大 , 在那里他病倒 , 并于1月27日被确诊为COVID-19 。 他的病毒基因组来自一个重建的始祖节点 , 除了安大略省患者外 , 该重建的始祖节点在佛山和深圳(都在广东省)都有衍生的病毒变体 , 这与他的旅行历史相符 。 他的病毒基因组现在与其他受感染的北美人(一个加拿大人和两个加利福尼亚人)的基因组共存 。
研究团队还列举分析了系统发育网络中单个墨西哥病毒基因组的病例 , 该病例于2020年2月28日被诊断出 , 曾前往意大利 。 研究团队此次得出的网络不仅证实墨西哥患者病毒的意大利起源 , 还显示该意大利患者病毒源自2020年1月27日第一例德国确认感染者 。 该感染者为慕尼黑的伟巴斯特员工 , 而这名德国感染者接触过一名中国同事 , 该名中国同事在前往德国前曾和来自武汉的父母接触 。
研究团队提到 , 这段从武汉到墨西哥的病毒路径持续了一个月 , 通过系统发育网络中的10个突变记录了下来 。
『新冠病毒』考古泰斗重建新冠进化图:三种类型,早期东亚地区病毒突变慢
本文插图

该墨西哥患者的病毒位于系统发生网络B簇中 。 该墨西哥患者在确诊前曾到访意大利 , 该网络显示意大利人和墨西哥人的病毒基因组之间有6个突变的突变距离 。 意大利患者病毒与慕尼黑患者病毒的区别仅在于一个突变 。 这名慕尼黑患者被认为是德国第一例感染病例 。
研究团队表示 , “在COVID-19的进化路径被大量突变所掩盖之前 , 我们详细描述的病毒网络是一种流行病早期阶段的‘快照’ 。 ”他们认为 , 这些系统发育方法可以应用于最新的冠状病毒基因组测序 , 以帮助预测未来全球疾病传播和激增的热点区域 。
论文链接:https://www.pnas.org/content/pnas/early/2020/04/07/2004999117.full.pdf【『新冠病毒』考古泰斗重建新冠进化图:三种类型,早期东亚地区病毒突变慢】(本文来自**** , 更多原创资讯请下载“****”APP)


推荐阅读