国外同行驳斥中国学者的新冠病毒演变论

国外同行驳斥中国学者的新冠病毒演变论国外同行驳斥中国学者的新冠病毒演变论
杨连宁摘转中国国内学者近期发表在国内期刊上的新冠肺炎(武汉肺炎)病毒演变论文遭到海外同行批评 , 被指学术不严谨及无合理解释 , 甚至有同行建议中国学者撤回该论文 。中国科学院旗下的学术期刊《国家科学评论》3月3日发表题为“关于SARS-CoV-2的起源和持续进化”的论文 。 作者系北京大学生命科学学院生物资讯中心研究员陆剑与中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰 。论文对新冠病毒全基因组分子进行进化分析 , 指新冠病毒目前已经演化出L和S两个亚型 , 这两个亚型在地域分布以及人群中的比例相距甚远;根据新型冠状病毒的演变方式 , 作者推测这两种亚型的传播能力、致病严重程度或许存在较大区别 。首先 , 结论非常粗糙 , 且病毒样本规模较小研究分析的103个新冠病毒基因组(病毒株)资料全部来源于公共数据库 。 这些进行比较的病毒样本的基因序列资料分别来自:武汉市27例、中国大陆其它地区的33例、台湾3例和中国以外40例患者的公开病毒样本 。收集时期最早是去年12月24日 , 最晚是今年2月5日 。爱丁堡大学遗传学家安德鲁·兰巴特(Andrew Rambaut)在推特上发文说 , 如果基因序列样本只是被感染群体的一小部分 , 且样本是随意收集的 , 那“完全可以期望”会得到科学家想要的遗传变异结论 。他补充说 , 病毒突变必须是病毒的表现不同才算 , 中国同行得出的只是“一个有缺陷的推论” 。就连世界卫生组织(WHO)官员也对这篇论文的结论持非常谨慎的态度 。世卫组织负责协调新冠病毒流行病应对的迈克·瑞安(Mike Ryan)说:“新冠病毒现在略有不同的特征 , 但不是本质上不同的病毒 。 ”他警告说 , “不应过度解释”科学家的发现 , “这一点很重要” 。“台湾冠状病毒之父”、中研院士赖明诏认为 , 新冠病毒顶多是“变异” , 还没有到变种的程度;且变异相当少 , 最重要的蛋白质基因还没有变化 。 他提醒说 , 如果病毒有变种 , 那做出来的疫苗就会没有效果 。赖明诏表示 , 新冠病毒的发源地就是在中国 , 因为新冠病毒的基因序列和云南山洞蝙蝠的冠状病毒很像 , 应该是从蝙蝠的冠状病毒来的 。 至于是否可能是人造病毒 , 赖明诏说 , 没有办法排除 , 但可能性相当低 。第二 , 数据存在多种可能的解读 , 但中国学者的解释说不通中国学者在实验中使用了系统动力学分析技术 , 对病毒的多个样本基因组进行收集和测序 , 并对它们的DNA或RNA中的微小取代物进行搜寻 。 通过追踪这些遗传变化 , 重构出病毒通过种群的粗略构图 , 并在此过程中检测转折点 。他们先将样本与从蝙蝠身上提取的样本进行比较 , 发现只存在相对较小的变异 。 所以认为 , 新型冠状病毒虽然在人与人之间传播了几个月 , 但在人传人以及自我复制方面变化不大 。随后 , 他们比较每个样本的30,000个核苷酸 , 结果发现样本之间存在更大程度的变异性 。论文说 , 发现病毒株一共存在149个突变位点 , 且多数突变在近期发生 。 在这103个病毒株中 , 有101个属于两个亚型之一 。 具体而言 , 两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28,144位点 , L型是T堿基(对应亮氨酸 , Leu) , S型是C堿基(对应丝氨酸 , Ser) 。通过与其它冠状病毒比较 , 作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近 , 从而得出S型相对更古老的推论 。此外 , 文章还提出一种反常现象 , 指更老的S型新冠病毒没有因为在人群中传播的时间更长 , 而感染更多的人 。文章说 , 基因组资料表明 , 感染S型的比例占30% , 反倒是相对年轻的L型新冠病毒的感染比例占70% , 而且每个L型病毒株比S型携带了相对更多的新生突变 。于是 , 作者进一步推测:“L型病毒传播能力更强 , 或者在人体内复制更快 , 因此可能意味着其毒力也更大 。 ”他们写道 , 这表明新冠病毒自传染给人以来、发生的变化“比以前估计的要大得多” 。一些没有参与这项研究的国外遗传学家纷纷质疑中国同行的这一研究 。国外学者指出 , 如果S型是首先传播的较早版本 , 那怎么解释:从武汉市最早一批患者身上采集的大多数样本都属于L型?如果S型更早的话 , 那武汉患者体内不应该有更多的S型吗?国外学者认为 , 这些数据也可能支持另一种解释:新冠病毒的传播范围比中国学者设想的要广泛 , 并在此过程中发生了随机突变;而这些突变可能会、也可能不会使病毒的作用机制变得不同 。来自苏格兰格拉斯哥MRC大学病毒研究中心的一组研究人员对中国学者的论文进行详细分析 , 他们认为 , 中国学者是误读了他们自己的数据 , 而且未能在论文中解释其统计方法的局限性 。如中国学者在他们论文中自述 , 这一病毒变异发现还需要在其他患者的更多样本中去观测 , 并且病毒的遗传差异还需要与医生报告和流行病学记录进行对比 , “只有这样 , 才能排除质疑” 。苏格兰格拉斯哥MRC大学病毒研究中心发文说 , “鉴于上述缺陷 , 我们相信中国同行应该撤回他们的论文 , 因为文章的结论显然没有根据 , 并且在疫情爆发的关键期 , 该文有散布危险的、不实信息的风险 。 ”第三 , 中国论文的潜台词具有甩锅的政治意义如果简单一句话概括这篇3月3日刊出的中国论文 , 就是国外出现的新冠病毒是变种 , 跟中国源自武汉的新冠肺炎无关


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