血液病|陈苏宁教授:NGS在血液病精准诊断中的应用|中国血液学发展大会

首届中国血液学发展大会于2021年1月29日至30日以线上交流的形式召开 , 会议主题为“新阶段、新理念、新格局——开启血液学高质量发展新征程” 。 本次会议邀请了血液学及其相关领域专家和同仁 , 共同探讨中国血液学发展大计 。 在“精准诊断专题论坛”的直播中 , 苏州大学附属第一医院陈苏宁教授以“NGS在血液病精准诊断中的应用”为题进行演讲 , 医脉通将报告的主要内容整理如下 。
血液病|陈苏宁教授:NGS在血液病精准诊断中的应用|中国血液学发展大会
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陈苏宁 教授
苏州大学教授、主任医师、博士研究生导师
江苏省血液研究所副所长
中华医学会血液学分会委员
江苏省医学会血液学分会候任主任委员
主持美国白血病淋巴瘤协会、江苏省杰出青年基金、国家自然科学基金等项目10余项
获2017年吴孟超医学青年基金奖 荣获国家科技进步奖二等奖2项 , 省部级科技进步一等奖3项
作为通讯作者在Blood、Leukemia、Haematologica等刊物发表SCI论文50余篇
NGS在血液肿瘤诊疗的应用
【血液病|陈苏宁教授:NGS在血液病精准诊断中的应用|中国血液学发展大会】血液肿瘤的诊断和分型依赖于形态学、免疫表型检测、分子遗传学检测等多种检测方法的联合使用 。 陈苏宁教授表示各类细胞和分子遗传学技术是现代血液病诊断、分型、风险分层、疗效判断的核心技术 。 随着遗传学技术的进展 , 特别是基因芯片和第二代测序技术的发展 , 使得对遗传学异常的分辨率越来越高 , 已达到单个碱基水平 , 众多基因异常特别是基因突变的发现 , 加深了对血液肿瘤发病机制的理解 , 也对血液肿瘤的诊断和治疗产生巨大影响 。
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陈苏宁教授随后对目前的NGS平台进行了介绍 , 他表示NGS平台各有优劣:Ion测序仪对相同数据量测序速度快;Illumina测序仪数据质量更好 , 通量更大 。 建库方法中扩增子方法建库简单、建库速度较快、测序仪数据量利用率高、建库及测序成本相对较低、建库模板量要求低;探针捕获方法适用大组套检测、高GC区域覆盖度更好、大片段插入缺失突变检出率高 。
NGS技术在血液肿瘤中的应用领域包括:诊断和分型、危险度分层、治疗靶点筛选、微小残留病检测、耐药机制 。 血液肿瘤中越来越多的分子异常作为诊断、分型、亚型鉴别的重要依据 。 单纯依靠传统MICM检测技术 , 难以胜任对血液肿瘤分型有重要意义分子标志的检测任务 。 NGS技术有着独特的高通量检测优势 。 超过60%的急性淋巴细胞白血病(ALL)患者可检出核型异常 , 对指导治疗和判断患者的预后有重要意义 , 并已成为WHO分型的重要依据 。 随着芯片和新测序技术的应用 , ALL患者中发现越来越多的基因突变或其他异常 , 并逐渐应用于ALL的临床诊疗 。
NGS依赖的分子标志物对患者的危险度分层具有重要的价值 , 目前临床指南中均纳入了细胞遗传学和分子标志物的危险度分层 。 MDS预后国际工作组分子委员会数据分析显示:12个基因提示MDS患者生存缩短 。 2014年公布的一项BCR-ABL1样ALL的基因组学研究结果显示:Ph样ALL的分子异常可以提供靶向治疗线索 。 NGS技术检测MRD的标志包括:基因突变、融合基因、Ig和TCR重排 , 其中Ig和TCR重排适用于大多数急性和慢性淋巴系统肿瘤 。
TKIs耐药是慢性髓细胞白血病(CML)治疗的主要障碍 , 包括原发和继发耐药 。 研究显示TKIs的耐药机制和ABL1激酶区突变、BCR-ABL1基因的扩增等因素存在关联 。 直接测序法是核算序列鉴定的金标准 , 也是目前最广泛使用的检测方法 。 其优点在于直接分析基因序列 , 可检测所有可能发生的突变 , 缺点在于敏感度低、耗费人力、效率较低 。 目前指南已经推荐使用NGS检测耐药突变 。
NGS在非恶性血液病诊疗中的应用
出凝血疾病属于非恶性血液病 , 包含出血性疾病和血栓性疾病 。 陈苏宁教授表示与恶性血液病相比 , 出凝血疾病具有牵涉多个系统及临床各个学科、包含大量罕见病种、诊断和治疗依赖于实验室检测的特征 。 苏州大学附属第一医院2017年至2020年对912例出凝血疾病患者基因检测结果统计显示:395例患者确诊遗传缺陷 , 确诊率43.3% , 发现新致病基因位点51例/66个位点 。
陈苏宁教授最后总结道:NGS对血液病的诊断、分型、危险度分层、治疗靶点筛选、疗效判断和MRD监测有重要意义 。 NGS将与其他血液病诊断技术有机整合 , 成为血液病精准治疗的核心技术 , 需要正确发挥NGS技术在血液病诊断中的价值 。
血液病|陈苏宁教授:NGS在血液病精准诊断中的应用|中国血液学发展大会
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