IT|33岁香港男子出院120余天后感染不同毒株 抗击新冠蒙上阴影?

新冠疫情发展至今 , 最新的动态是:全球首例康复后二次感染新冠病毒的病例出现了 。2020 年 8 月 24 日 , 香港大学李嘉诚医学院微生物学系袁国勇团队发布声明证实 , 下一代测序技术首次检测出了康复后再次感染 SARS-CoV-2 病毒的病例 。
次日 , 该团队题为 COVID-19 re-infection by a phylogenetically distinct SARS-coronavirus-2 strain confirmed by whole genome sequencing(全基因组测序证实一株系统发育不同的 SARS-CoV-2 毒株的再感染)的研究成果被学术期刊《临床传染病》(Clinical Infectious Diseases)接收 。
IT|33岁香港男子出院120余天后感染不同毒株 抗击新冠蒙上阴影?
文章图片

对此 , 上海复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏也发声:

“再感染”病例并非一般意义上的“复阳” 。还需要进一步的研究证据来判定这例患者的情况是停留在新闻级别还是学术级别 。
全球首例新冠康复者二次感染
据悉 , 这一病例的基本情况是:男性 , 33 岁 , 2020 年 3 月 26 日确诊 , 属轻症感染患者 , 3 月 29 日住院 , 4 月 14 日出院 。8 月经英国到西班牙旅行 , 8 月 15 日在香港机场接受入境检查时 , 经口咽后唾液检测呈 SARS-CoV-2 RT-PCR 阳性 。
该患者第二次感染属无症状感染 , 距离首次确诊有 142 天 。住院后 , 患者体温及其它指标均正常 , 胸透无任何异常 , 体内病毒载量也在不断下降 。
实际上 , 这则病例二度确诊的背后 , 有一个大背景——已被治愈的 COVID-19 患者是否会再感染 , 学界一直没有明确的答案 。
具体来讲 , 由于在接近 RT-PCR 检测的最低水平上 , 病毒会持续脱落 , 因此不少转阴出院的患者容易出现“复阳”的情况 。
与此同时 , 此前有一例病例报告显示了再感染的可能性 , 但并未进行病毒基因组分析 。
因此 , 这些病例引起了再感染(re-infection)与持续病毒脱落(viral shedding)之间的争议 。
袁国勇团队在该患者两次 COVID-19 发作期间收集到的呼吸样本上直接进行了全基因组测序 , 并进行比较基因组分析 , 旨在区分再感染与持续病毒脱落 。测序得到的实验室结果包括 RT-PCR Ct 值和血清 SARS-CoV-2 IgG 。
分析表明 , 该患者两次感染的病毒株基因排序有显著的不同 。
其一 , 与全球共享流感数据倡议组织(GISAID)的病毒基因组相比 , 第一次感染的病毒基因组在特征性基因片段 orf 8 的第 64 位具有终止密码子 , 存在58个氨基酸缺失 , 且在系统发育方面与 2020 年 3/4 月收集的菌株密切相关;而第二次感染的病毒基因组与 2020 年 7/8 月收集的毒株密切相关 。
IT|33岁香港男子出院120余天后感染不同毒株 抗击新冠蒙上阴影?
文章图片

其二 , 两次感染的病毒之间存在着位于 9 种不同蛋白质中的 23 个核苷酸和 13 个氨基酸的差异 , 比如 B 细胞和 T 细胞表位的位置差异 。
同时血清学证据表明 , 该患者第二次感染后 , C-反应蛋白(指机体受到感染或组织损伤时血浆中一些急剧上升的蛋白质)和 SARS-CoV-2 IgG 血清转换升高 。
基于上述分析 , 袁国勇团队给出的结论是 , 流行病学、临床、血清学和基因组分析证实 , 患者属再次感染 , 而非第一次感染后的持续病毒脱落 。
同时该团队也强调 , 即便是可以进行疫苗接种 , SARS-CoV-2 仍可能在人群中继续传播 , 康复者也应保持防疫意识 。
再感染并非所谓“复阳”
首例再感染病例出现后 , 网友议论纷纷 , 实际上这一研究对于接下来的疫情研究有几点启示:
第一 , 关于二次感染病例的判定 。
知乎高赞答主、中国科学院大学遗传学博士李雷回答称 , 要想判定二次感染病例 , 首先可以通过一些情况进行排除 , 再对两次感染的病毒株序列进行比较 。
IT|33岁香港男子出院120余天后感染不同毒株 抗击新冠蒙上阴影?
文章图片

【图源李雷知乎回答】
实际上这种判定思路正是袁国勇团队的做法——通过区分再感染与持续病毒脱落 , 排除“复阳”的可能性 , 发现两次感染的病毒株基因排序的不同 。
第二 , 关于疫苗 。


推荐阅读