|NGS肿瘤检测大Panel成大势所趋,「和瑞基因」如何卡位百亿蓝海?( 二 )


那究竟该如何综合判断一款大Panel产品?检测结果“既全又准” , 一定是大家对肿瘤基因检测的希望:更大的覆盖区间意味着可以检测到更多的基因位点 , 是保证检测结果“全面”的因素;而测序深度越深 , 意味着在同一区域测序次数的增加 , 会极大地增加产出的数据量 , 是保证检测“精度”的因素 。
也因此 , 在控制测序总成本的时候 , 基因测序的覆盖范围和深度成为相互掣肘的两个方面 , 需要根据自身的技术实力和临床需求寻找一个平衡点 。 另外 , 涵盖的有效检测区间、覆盖的免疫指标、突变类型、测序深度等 , 均是肿瘤基因大Panel需要综合考虑的衡量指标 。
因此 , 在产品研发和产品化的过程中 , 和瑞基因也进行了多维度的思考 。 陈素争指出 , 首先有参考和瑞基因自有的肿瘤基因组数据库和百万人的基因组数据库 , 另外要保证产品设计的前瞻性 , 来综合选定基因范围 , 并考虑测序深度以及利用何种软件进行分析等等 , 最终呈现为现如今的“和全安”大Panel(654基因)产品 , 并在不同指标之间找到了一个平衡点:

  • 首先 , 覆盖654个基因 , 其中638个是全外显子基因 , 检测范围更广泛 , TMB分析更准确 , 可满足靶向治疗的指导、免疫治疗的指导、化疗用药的指导以及肿瘤遗传风险分析;
  • 其次 , 15,000X的高测序深度 , 能获得更多序列信息进行统计分析 , 减少偏差的产生 , 和5000X相比 , 15,000X测序低丰度灵敏度提高20%~40%左右 , 有效减少临床样本低丰度突变漏检风险;
  • 第三 , 全面覆盖NMPA/FDA获批及在研的靶点及新兴的免疫治疗生物标志物 , PD-L1、MSI、TMB、TNB、HLA分型、免疫正负向基因;针对最为复杂的基因融合型变异 , 654大Panel产品能够进行42个融合基因的检测 , 并且进行DNA+RNA 融合双重检测;
  • 最后 , 组织与液体版全部覆盖区域3M+ , 拥有更大的检测区间 , 捕获区域更大 , 更全面捕获变异基因信息 , 减少漏检风险 。
临床应用未来可期
据和瑞基因CEO周珺介绍 , 接下来 , 公司将正式将这款应用推向临床 。 “结合行业趋势来看 , 过去既有的传统的、老的多基因检测产品 , 从检测公司的角度来看 , 现在临床对它们的需求是越来越大 , 这慢慢也会成为我们主要的产品线 。 ”
至于大Panel基因检测的临床应用前景 , 根据兴业证券研报 , 在2019年 , 中国仅有6.4%的晚期癌症患者和被建议进行癌症基因分型检测的癌症患者采用NGS癌症伴随诊断检测 , 而美国这一比例达到 23.5% , 未来随着药物可及性上升以及渗透率的不断提高 , 中国肿瘤NGS基因检测的伴随诊断市场预计将从2019年的3亿美元增加到2030年的45亿美元 。
杨帆教授则表示:“随着靶向治疗、免疫治疗药物越来越多、随着以分子分型为依据进行靶向治疗方案选择的篮子试验越来越多 , 大Panel基因检测的必要性越来越高 , 能够使受检者有更多的临床获益 。 小Panel针对性强 , 费用较低 , 大Panel涵盖的基因数多 , 可以指导靶向治疗 , 评估化疗的毒副作用和免疫治疗的疗效 。 临床医生可结合患者的癌种/分期/NCCN指南推荐等为患者甄选合适的大/小Panel 。 ”
在技术和需求的多重驱动下 , 目前已有越来越多基因测序企业涉足NGS大Panel检测服务 , 譬如联川生物、金橡医学、世和基因等 。
不过值得思考的是 , 目前靶向药免疫治疗产品可选择范围较小 , 做大Panel检测可发挥的价值似乎不大 。
对此 , 杨帆教授解释到 , 大Panel某种意义上提供的一个一站式的广覆盖 , 很多患者的标本的数量和取材难度决定了他并不能接受一系列的检测;另外 , 现在肿瘤治疗也比较复杂 , 并靶向治疗很多最后的结局是耐药 , 耐药之后也会携带各种突变 , 且不同的突变点对后续药物的耐药与否又差别很大 , 也需要找到准确突变点 。


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