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「」新冠疫苗的研发周期会缩短吗？一定会，超级计算机帮忙我们做到

目前全球科学界正在联手 ， 为了解、追踪、预测、测试和找到治愈当前冠状病毒大流行的方法 ， 作出了前所未有的努力 。但在危机中 ， 每一秒的损失都意味着更多的生命损失 ， 光靠团结是不够的 。超级计算机使科学家进行研究、收集和分析数据的速度大大加快 。在这场COVID-19大流行期间 ， 它们从未向社会证明过自己的价值 。
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超级计算机为正在研究COVID-19的科学家提供了独特的能力：他们可以在分子水平上探索病毒的结构和行为 ， 同时设计药物和预测疾病的传播速度比其他方法要快得多 。
德克萨斯州高级计算中心（TACC）于2020年2月开始响应计算时间请求 ， 协助打击COVID-19 。今年3月 ， 白宫通过COVID-19高性能计算（HPC）财团（COVID-19 High-Performance Computing ， HPC）招募了一些世界上最强大的超级计算机 ， 这是一个公私合作伙伴关系 ， 为全世界的研究人员提供了大量的计算资源 。
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作为这项工作的一部分 ， 他们正在与团队密切合作 ， 为这里和世界各地的超级计算资源提供优先访问权 。在很多公司仅此一项 ， 就有100多个项目 ， 涉及数千名研究人员 ， 使用HPC系统来预测家庭订单和学校停课等干预措施的效果；模拟使病毒具有毒性的蛋白质的分子行为；了解病毒的遗传学及其易变性；筛选潜在药物和疫苗的有效性 ， 可视化并与决策者交互共享数据 。
【「」新冠疫苗的研发周期会缩短吗？一定会，超级计算机帮忙我们做到】在TACC ， 近三分之一的计算时间都在致力于加速这些努力 ， 相当于40000台台式计算机不停地运算 。如果没有美国国家科学基金会（NSF）和能源部（DOE）为高性能计算提供的联邦资金 ， 这一切都不可能实现 。40多年来 ， 美国国家科学基金会（NSF）和能源部一直将开放访问超级计算机作为其任务的一部分 。
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除了大型机器之外 ， 超级计算中心还雇佣了一些计算科学领域最聪明的人 ， 这些人正与全球各地的团队合作 ， 快速进行研究 。
这些合作伙伴包括德克萨斯大学奥斯汀分校COVID-19建模联盟 ， 该联盟由劳伦·安塞尔·迈耶斯博士领导 ， 开发了基于病毒传播和实时手机数据的疾病传播的领先流行病学模型之一 。白宫和疾控中心 ， 以及全国媒体和公众 ， 都利用这一模式来告知他们的理解和决策 。
美国能源部阿贡（Argonne）和布鲁克海文国家实验室（Brookhaven National Laboratories）的一个团队应用了世界上几台最强大的超级计算机 ， 加速了基于人工智能的药物对接方法 。他们的努力将60亿个可能的小分子缩小到了30个 ， 最大的可能是与病毒的一种蛋白质结合并破坏其功能 。这些正在芝加哥大学的实验室进行测试 。
以TACC为动力的COVID-19药物发现联合会正在与世界上最大的筛选化合物供应商Enamine、德克萨斯A&M波士顿大学和德克萨斯大学医学分支机构合作 ， 以确定最有希望、最容易获得的600种药物 ， 类药物分子2.6条并在高度封闭的实验室进行测试 ， 以便在数月而不是数年内找到潜在的药物 。新项目每天都在启动 。
在这些案例中 ， 长期的研究合作有助于加快项目的实施 。UT奥斯汀建模联盟的预测建立在梅耶斯团队对流感大流行建模的十年联邦资助研发的基础上 。美国能源部的研究人员采用了基于人工智能的SARS-CoV-2癌症药物发现方法 。药物发现协会利用多年来开发的工具和方法打击生物恐怖主义 。这些团队的持续关系使他们能够在致力于共同利益的过程中转移他们的研究重点 ， 扩大他们的范围 ， 减少限制 。


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