现有的基因序列方面的证据还不能证明病毒源自西方

在论述“现有的新冠病毒的基因组序列方面的数据、信息并不能证明新冠病毒来自于海外”这个观点前 , 小伙伴们请先看看下面这个新闻:现有的基因序列方面的证据还不能证明病毒源自西方。新华信用每日辟谣
转自《解放军报》报社主办的网站“中国军网”中如下这个地址的网页:http://www.81.cn/2020zt/2020-03/02/content_9756895.htm……(前略)谣言2:美国病毒是5株 , 中国2株 , 伊朗的1株和美国一样流传的消息称 , 美国确诊的新冠肺炎病人的毒株是5株 , 而中国只有2株 , 伊朗病人的只有1株 , 并且伊朗的这1株还不是我国病人2株中的任意一株 , 而是美国5株中的其中一株 。目前没有太多关于伊朗病毒株的研究 , 直接说“伊朗的1株和美国一样 , 与中国不同”也没有任何根据 。 事实上 , 从美国和伊朗的关系来看 , 直接由美国传播给伊朗的可能性非常小 。国内没有发现美国有的其他3种单倍型 , 更可能的原因是我国现在提交的病毒数据数量太少 , 很多是同一个传染源来的 。 不能说我们国家没有美国的其他单倍型 , 可能只是我们提交的数据中没有检测到 。美国2个特殊的单倍型有武汉旅行史 , 而且根据流行病学资料 , 在武汉感染的几率很大 。 —————————————————————————————————现在 , 就请看看下面这篇文章:现有的基因序列方面的证据还不能证明病毒源自西方。面对新冠肺炎要警惕:不应过度解读新冠病毒基因序列分析
本文原载于“腾讯”网的这个网页:https://xw.qq.com/cmsid/20200311A0KTPN00 , 但本人综合“搜狐”网上的《<Science>:突变或导致新冠病毒更快速的传播,但这也容易被过度解读》 , 对本文的叙述顺序作了一点改动 , 并补充说明了此文当中的消息的最初来源 。 (“搜狐”网上的那篇文章的具体地址则是:https://www.sohu.com/a/379170008_139908)新冠疫情全球暴发 , 共享新型冠状病毒基因组序列十分重要 。 但在资源共享、推进科学发展对抗全球疫情的同时 , 也切不可放弃科学的严谨 , 而应警惕对于数据的片面放大性的解读 。随着新冠疫情的爆发 , 也催生了论文“洪流” 。 虽然快速共享病毒信息的好处远远大于坏处 , 但有的信息很容易被过度解读 。 北京时间3月10日 , 国际上权威的学术刊物《科学》杂志发表文章对此进行了报道 , 现将《科学》杂志那篇文章的主要内容摘录在下面:2020年2月28日 , 德国柏林Charité大学医院的病毒学家Christian Drosten发布了从一位德国患者身上分离出的新冠病毒 (SARS-CoV-2)的基因组序列 , 随后 , 他立刻在twitter上发布了一条警告:目前 , 分析解读新冠病毒的基因序列还不是时候 , 很容易过度解读 。 随着病毒开始在全世界传播 , 全世界350多个科学家已经在GISAID(Global Initiative on Sharing All Influenza Data , 一个旨在快速共享流感数据的网上平台)平台上贡献了新冠基因组序列 , 这些信息为研究新冠病毒的传播和演化提供了线索 。 但是 , 这些序列仅占所有病例的极小一部分(截止2020年3月10日 , 全球已经有近12万人感染了新冠病毒) , 而且其间只有很少的显著的序列差异 , Drosten很快意识到 , 这些序列很容易被过度解读 。 现有的基因序列方面的证据还不能证明病毒源自西方
图1. 德国柏林Charité大学医院的病毒学家Christian Drosten(来源于Berlin Institute of Health的官网)Drosten分析的新冠病毒基因序列来自于一位在意大利感染了新冠肺炎的德国人 。 这位患者的病毒基因组序列看起来和一位德国慕尼黑患者的类似 , 而这位慕尼黑的患者要比德国患者早一个多月感染新冠肺炎 。 两人的病毒基因组都有三个突变 , 是在早期中国患者的序列中没有发现的 。 Drosten意识到 , 这一发现可能会让人认为意大利的疫情暴发是由那位来自德国慕尼黑的病例“点燃”的 。 然而 , 巴伐利亚州 (慕尼黑是这个州的首府)的公共卫生官员表示 , 经过追踪和隔离14个确诊病例的所有可能的接触者 , 巴伐利亚的疫情已被扑灭 。 Drosten认为 , 也不能排除另一种可能:携带有这三个基因突变的其他感染者分别接触了意大利和德国的患者 。 他在Twitter上称 , 新公布的基因组“不足以表明慕尼黑和意大利的病例之间有关联” 。然而 , Drosten的警告并没有引起学术界的重视 。 几天后 , 美国福瑞德·哈金森肿瘤研究中心(Fred Hutchinson Cancer Research Center)的Trevor Bedford分析了一系列的病毒基因组序列以后 , 连续发布推文进行讨论 。 他写道:根据基因组序列的分析 , 病毒传播的路线意味着德国巴伐利亚州的疫情根本没有得到遏制 , 并且很有可能导致了意大利暴发疫情 。 Bedford的言论传播得很广 , 《麻省理工技术评论》杂志断言 , “慕尼黑病例可能与很大一部分的欧洲疫情有关联” , 很多Twitter用户要求德国出来道歉 。 现有的基因序列方面的证据还不能证明病毒源自西方
图2. Bedford发布的推文串(Threads)现有的基因序列方面的证据还不能证明病毒源自西方


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