地球■地球上第一个病毒怎样诞生的？( 二 )
为了建立病毒的进化树 ， 他和阿尔上·纳西尔处理了大量数据 。 他们用强大的统计算法筛选了3640种病毒和属于三域系统的1620种细胞产生的1100万种蛋白质 。 借助一个囊括几千种组成和三维结构已知的蛋白质的数据库 ， 他们比较了上述蛋白质的化学组成 ， 首先推断出它们结构域的形态 。 这是一种复杂的概率计算 ， 但古斯塔沃·凯埃塔诺-安诺莱斯表示 ， 预测结果“现已得到蛋白质X光研究证实 ， 准确性达95%至98%” 。
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乙型肝炎病毒
然后 ， 研究人员鉴别出那些最常见的蛋白质结构域 。 他们统计了1995种 ， 其中66种为病毒所独有 。 很难相信造成这一切的基因源自LUCA ， 要是这样的话 ， 三域系统的生物也该携有这些结构域 。
他们由此得出结论：病毒源自几种迥异于我们共同祖先谱系、并与之共存的细胞 。 它们有着自己的进化树 ， 但与我们的进化树交织 。 我们应当把它们视为生物 ， 因为它们源自生物祖先——进化论无法想象生命物种在进化过程中失去活性 。
进化的关键 法国病毒学家迪迪耶·拉乌尔（Didier Raoult）和让-米歇尔·克拉弗里（Jean-Michel Claverie）在2003年发现“巨型病毒”后也提出了这种观点 。 “我们也发现了病毒独有的基因 。 ” 让-米歇尔·克拉弗里兴奋地说 ， “我不知道如何解释一些病毒共有的基因结构却不存在于细胞世界 ， 除非假定它们源自先于LUCA存在的细胞祖先 。 ”
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不仅是巨型病毒（此处为拟菌病毒） ， 所有病毒都可能源自细胞祖先 。
这种假设病毒源自细胞的理论的支持者仍然只占少数 。 但古斯塔沃·凯埃塔诺-安诺莱斯并不放弃：“我们的成果有着坚实基础 。 进化论者太执着于基因序列 。 大部分人还没有看到蛋白质结构分析的上升势头 。 ”
法国巴斯德研究所的进化专家帕特里克·福尔戴尔（Patrick Forterre）认为 ， “要想获得正确描述病毒史的进化树 ， 还有许多工作要做” 。 不过他也为这场论战感到高兴：“这有助于使病毒重新回到进化论者的视野之中 ， 过去它们一直是重要的缺席者 。 ”
论战正在进行：说不定病毒真是原始汤的另一群幸存者呢？
撰文 Román Ikonicoff
编译 周佩琼
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