唐驳虎：美国和中国的病毒，谁是爷爷辈？看图！
文/凤凰新闻客户端荣誉主笔 唐驳虎前面4篇 ， 讲完了用一两句话总结就是： 流行病学调查（简称“流调”）19世纪靠“猜”、20世纪靠“找”、21世纪靠“算” 。19世纪是马车、20世纪是汽车 ， 21世纪是高铁、飞机、火箭 。其他领域如此 ， 生物领域更是如此 。现在 ， 我们要坐着飞机和火箭 ， 从正确的起点出发去找了 。
传统流调的贡献与极限综合各媒体的报道 ， 12月底 ， 在武汉中心医院、新华医院（中西医结合）等医院 ， 指示病例（Index Case）几乎同时爆发 ， 各医院的6~7例非典型肺炎病例 ， 都被尽职尽责的医生们注意到 ， 并立即上报 ， 拉开疫情序幕 。随后 ， 各医院的医生 ， 又在本院病例库里 ， 追踪了本单位原发病例（Primary Case） ， 找到了更多12月发病的病例 ， 并描绘成曲线 。
目前临床库里追踪到最早的病例 ， 分别是12月初的华南果品市场摊贩、12月初附近小区常年瘫痪卧病在床的老年痴呆患者 。显然 ， 这些还都不是真正意义的“原发病例” 。如果公共卫生调查力量介入 ， 在去年11月的武汉 ， 理论上有可能找到所谓的“1号病人”——按流行文化和热门网文的定义 ， 大致是人类世界里第一个患病的患者 。但想找到严格意义的“0号病人”——按流行文化和热门网文的定义 ， 大致是人类世界里第一个被动物感染、但却没有生病的患者 。然后又是他把病毒传播开来 ， 最终产生了“1号病人”的感染-传染者 ——但这是不可能的 。
从疫情发生到现在 ， 武汉市中心医院急诊科主任艾芬 ， 带领着近200人的团队 ， 50多天不下火线 ， 日夜坚守在发热门诊、留观病房(武汉广播电视台)因为现在大家都知道了无症状感染者、病毒潜伏期的概念 。无论你找到谁 ， 你怎么证明 ， 在他/她之前的1~2个最长潜伏期（14~28天）内 ， 就一定没有别的疑似病例、没有无症状感染者？ “会不会还有上家”？ 这没法证明 。而且 ， 由于当时的患者已经治愈、自愈或者病亡 ， 做核酸检验已经是过去式 。就是做最灵敏、有记录的血清抗体检验——现在武汉好几万病愈患者、自愈的轻症患者、无症状感染者 ， 如何确定感染时间先后？如何确定谁是去年11月而不是今年1月不知不觉感染上的“无症状患者”？ 现在也完全区分不开了 。
所以 ， 传统流调的追溯极限大概就是这里了——它提供了病情溯源的起点 。但要继续局限在这个办法里“找” ， 那就是驾马车钻死胡同 。如前所述 ， 蠢得冒烟的行为 。要不仅掌握病毒在人类世界流传的“今生” ， 还要了解病毒之前在自然界演化的“前世” ， 必须用21世纪的分子生物学、生物信息学 。因为 ， 在病毒序列里 ， 记载着病毒传播演变的全部身份、历史 。也正如钟南山老先生所说 ， 必须要靠“溯源” 。
溯源工作的三个目标溯源工作的基本工具 ， 以前已经讲过很多次了 ， 就是基因测序（“测”）和生物信息学（“算”） ， 最重要的分析手段 ， 就是演化树定位 。这些都是全世界生物学界公认的基本标准 ， 现代生物学的基础地基 ， 也是实验室最常规的手段 ， 而不是什么科学前沿 。说白了 ， 中国懂 ， 美国也懂 ， 俄罗斯也懂 ， 一般国家都懂 ， 所有的生物研究者都懂 。
现在一台测序仪每天可完成 60 人的全基因组测序 ， 把 60 个人每人 31.6 亿bp这么复杂的生物DNA全部测出来 。新型冠状病毒只有不到 3万bp的单链RNA ， 不到一个人10万分之一的数据量 ， 在现代基因测序技术面前如同裸奔一般 。
以前没有基因测序 ， 各种阴谋论还真不好反驳 。但有了基因测序技术之后 ， 全序列清清楚楚 ， 都袒露在全世界面前 。病毒的变异、留痕 ， 都是公开透明的、可以追查的 。不认可的国家、专家可以自己调查研究 ， 样本现在全世界都有 ， 只是发出来的报告不要被全世界沦为笑柄就好 。
溯源工作至少有三个主要层面：1、研究病毒如何从动物进入人体； 搞清楚它从天然宿主到人类世界的路径 ， 通过什么中间宿主 ， 发生了什么基因变异、重组 ， 最后在什么场景下传入人类世界 。2、研究病毒在自然世界的演化史（“前世”）； 在自然界演化过程中 ， 病毒的特性是否发生了明显的定向的变化 。3、研究病毒在人类世界的传播史（“今生”）； 从武汉到全世界的扩散过程中 ， 发生了什么样的变化 ， 有没有出现传播能力和毒力的变异 。从关心程度来看 ， 可能大部分人关注的程度是1、2、3 。但从病毒溯源的过程来看 ， 逻辑步骤则应是3、2、1 。我们今天先来谈3 。
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