新冠病毒源头真的在美国？专家解读新论文
随着新冠病毒席卷全球 ， 一条“台湾节目追溯新冠病毒源头 ， 然后追到美国去了”的视频火了 。 节目中 ， 有关嘉宾判断新冠病毒源头可能在美国的主要依据 ， 正是前不久中国科学院西双版纳热带植物园、华南农业大学和北京脑科中心在ChinaXiv论文预印本网站上联合发布的一篇论文 。这篇引起台湾节目关注的论文说了啥？依据这篇论文 ， 能否得出新冠病毒的源头在美国的结论？为此 ， 采访人员特别邀请了兰州大学研究员赵序茅 ， 为大家解读这篇论文中的相关信息 。
Thumbnail view only, Click to view original病毒溯源：找啊找啊找“爷爷”此次台湾节目之所以将新冠病毒源头追到美国去 ， 一个重要理由是：在美国发现了单倍型H38的病毒样品 。什么是单倍型？从事气候变化生态学和保护生物学研究的赵序茅打了个比方：正如一个公司由多个职责不同的部门相互协作才能有效运转 ， 病毒的特性也由很多基因决定 ， 单个基因不能发挥作用 ， 这一个个单倍型就好比一个个独立的部门 。 简单说 ， 单倍型就是决定同一性状的基因组合 。这篇由中国科学院西双版纳热带植物园郁文彬等人合作的论文 ， 收集了覆盖四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据（截至2月12日） ， 并发现这93个病毒样本包含58种单倍型 。而且 ， 论文中 ， 单倍型演化关系显示 ， 单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型 ， 通过一个中间载体——mv1（可能是祖先单倍型 ， 也可能是来自中间宿主或“零号病人”）与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联 ， 并通过单倍型H3衍生出单倍型H1 。根据这一单倍型演化关系 ， 如果我们简单梳理 ， 可以得到下面的两组示意图：mv1→H13 →H3→ H1mv1→H38→H3→ H1这意味着什么？“最开始的是单倍型mv1 。 ”根据赵序茅的解读 ， 新冠病毒就像一个家族企业 ， H38和H13是病毒的第一代创始人 ， 我们可以称之为爷爷辈单倍型；之后的H3是病毒的第二代掌门人 ， 我们可以称之为父辈单倍型；而H3衍生出孙子辈H1 ， 则是病毒的第三代掌门人 。 正是这个孙子辈H1让病毒空前强大 ， 如日中天 。 H1又衍生出曾孙辈的H56和mv2 ， 作为第四代掌门人 。按照正常逻辑 ， 爷爷辈的单倍型所在地就是病毒的祖籍 。 但论文研究团队发现 ， 与华南海鲜市场有关联的患者 ， 其样品单倍型都是孙子辈的H1及其子孙后代（也就是单倍型H2、H8-H12） ， 仅有的一份武汉样品单倍型H3 ， 也就是父辈单倍型H3 ， 还与华南海鲜市场无关 。据此 ， 并结合病患发病时间记录和种群扩张时间 ， 论文研究团队推断：华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入进来 ， 在市场中发生快速传播蔓延到市场之外 。 换句话说 ， 该论文认为 ， 华南海鲜市场不是病毒发源地 。
Thumbnail view only, Click to view original疑问来了：源头在不在美国？研究到此并未结束 。 顺藤摸瓜 ， 论文研究团队对两个“古老的”单倍型 ， 即爷爷辈单倍型H13和H38的病毒样品又溯源 ， 发现他们是来自深圳的病患（广东首例）和美国华盛顿州的病患（美国首例） 。 其中 ， 美国的这个病患就是台湾节目中提到的单倍型H38的病毒样品 。既然爷爷辈的单倍型是在深圳和美国发现的 ， 那么这是不是说明深圳和美国就是新冠病毒的发源地呢？事情没有想象的那么简单 。 关于判断新冠病毒来源 ， 上海市新冠肺炎医疗救治专家组组长、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏在接受有关媒体采访时 ， 曾说了两点：一、这个病毒出现的时间点 ， 哪里最先出现的 ， 要追究这个时间的先后；二、要寻找它在进化树上面的位置 ， 后面基因的进化是在前面的基础上 。而追踪爷爷辈单倍型H13和H38患者的感染时间和活动轨迹 ， 论文研究团队发现 ， 两位患者的旅行记录显示 ， 他们应该都是2019年12月底至2020年1月初在武汉活动期间被感染的 。 换句话说 ， 论文研究团队认为两个爷爷辈单倍型H13和H38来自武汉 。
Thumbnail view only, Click to view original“此外 ， 台湾节目认为在美国的病毒中包含5个单倍型群 ， 所以美国是病毒起源 。 这说明美国感染病毒的途径比较多 ， 比如武汉、澳大利亚、深圳等 。 ”赵序茅分析 。因此 ， 基于这篇论文我们无法得出新冠病毒源头在美国的结论 。“根据基因组分析 ， 新冠病毒的源头并不在华南海鲜市场 。 其源头究竟在哪 ， 还需要相关研究者的继续追踪 ， 但根据目前的相关研究 ， 应该还在武汉 。 ”赵序茅称 。专家解读：美国流感中有些人可能死于新冠肺炎？既然如此 ， 现有武汉样本 ， 为何没检测到“爷爷辈”单倍型？论文研究团队认为 ， 这可能是因为现有样品主要采自几家定点医院 ， 而且样品采集时间局限于2019年12月24日和2020年1月5日 。按照赵序茅的话说 ， 武汉病毒样品采集时间较晚 。 随着病毒的推陈出新 ， 其单倍型不断壮大 ， 多样性不断丰富 。 “武汉因为采集时间较晚 ， 此时爷爷辈的单倍型很有可能已经被父辈、孙子辈的单倍型替换了 。 ”事实上 ， 关于这项研究的局限性 ， 论文作者郁文彬也曾在接受有关采访时坦陈 ， 这项研究有个不足 ， 那就是93个样本中 ， 武汉样本主要是早期的 ， 如果有更多武汉样本进行基因组测序的话 ， 可能在溯源方面可以找到更多的证据 ， 比如说找到H13和 H38单倍型 ， 可能可以帮助找到病毒来源 。
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