2019-Cov和RaTG13氨基酸序列对比

2020-02-18

2019-Cov和RaTG13氨基酸序列对比。在进行初步筛选后，科学家们发现和2019冠状病毒相似度最高的病毒为蝙蝠冠状病毒RaTG13 ，相似度为96% ，下图为两者S蛋白氨基酸序列对比。

可见， 2019冠状病毒与RaTG13相似度很高，与当年的萨斯病毒差异很大，值得注意的是图上黑框标注的位点，此位点为Furin蛋白酶的识别位点，在萨斯病毒和RaTG13中，此位点只有一个精氨酸，不具有Furin蛋白酶活性，但2019-冠状病毒的该位点却为RRAR ，具有Furin蛋白酶和胰蛋白酶的双重活性。除此之外，南开大学发表的论文“武汉2019冠状病毒S蛋白可能存在Furin酶切位点”中，得到了以下结论。

这个位点同时具有Furin酶切位点和胰蛋白酶酶切位点，在当年的萨斯病毒中不存在这个位点，在侵染细胞时， S蛋白必须以胞吞的形式侵染细胞，而现在的2019冠状病毒的S蛋白则能够在细胞表面被Furin蛋白酶切割成S1和S2两个亚基后再侵染细胞，这极大扩大了病毒的侵染效率，如下文所示。

也就是说，现在的2019冠状病毒，包装机制与HIV、鼠肝炎等病毒类似，而与以前的萨斯病毒完全不同，使其侵染效率扩大了100到1000倍。可以从序列中看出， 2019冠状病毒与蝙蝠冠状病毒RaTG13的序列相似度极高，即使存在变异，也几乎全部是单点变异，这种连续3个氨基酸的变化，还恰好位于Furin蛋白酶作用位点的变异，真的有可能是自然形成的吗？

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